RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441711.6

ARMC10-208, Transcript of armadillo repeat containing 10, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARMC10, Length 2,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARMC10-208	ENST00000441711	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
ARMC10-208	ENST00000441711	WDR97	A6NE52	1622 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ARMC10-208	ENST00000441711	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ARMC10-208	ENST00000441711	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ARMC10-208	ENST00000441711	NEFL	P07196	543 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ARMC10-208	ENST00000441711	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
ARMC10-208	ENST00000441711	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ARMC10-208	ENST00000441711	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ARMC10-208	ENST00000441711	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ARMC10-208	ENST00000441711	NES	P48681	1621 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ARMC10-208	ENST00000441711	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
ARMC10-208	ENST00000441711	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ARMC10-208	ENST00000441711	KIF27	Q86VH2	1401 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ARMC10-208	ENST00000441711	CCER2	I3L3R5	266 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ARMC10-208	ENST00000441711	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ARMC10-208	ENST00000441711	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.07	■■■□□ 2.89
ARMC10-208	ENST00000441711	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ARMC10-208	ENST00000441711	MSH5	O43196	834 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ARMC10-208	ENST00000441711	ANP32C	O43423	234 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ARMC10-208	ENST00000441711	TIAM1	Q13009	1591 aa		33	■■■□□ 2.87
ARMC10-208	ENST00000441711	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ARMC10-208	ENST00000441711	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ARMC10-208	ENST00000441711	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
ARMC10-208	ENST00000441711	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ARMC10-208	ENST00000441711	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ARMC10-208	ENST00000441711	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ARMC10-208	ENST00000441711	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.9	■■■□□ 2.86
ARMC10-208	ENST00000441711	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
ARMC10-208	ENST00000441711	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
ARMC10-208	ENST00000441711	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ARMC10-208	ENST00000441711	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ARMC10-208	ENST00000441711	IGF1R	P08069	1367 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ARMC10-208	ENST00000441711	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ARMC10-208	ENST00000441711	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
ARMC10-208	ENST00000441711	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ARMC10-208	ENST00000441711	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
ARMC10-208	ENST00000441711	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.71	■■■□□ 2.83
ARMC10-208	ENST00000441711	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ARMC10-208	ENST00000441711	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
ARMC10-208	ENST00000441711	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ARMC10-208	ENST00000441711	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ARMC10-208	ENST00000441711	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ARMC10-208	ENST00000441711	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ARMC10-208	ENST00000441711	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ARMC10-208	ENST00000441711	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
ARMC10-208	ENST00000441711	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ARMC10-208	ENST00000441711	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ARMC10-208	ENST00000441711	CUL7	Q14999	1698 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ARMC10-208	ENST00000441711	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.48	■■■□□ 2.79
ARMC10-208	ENST00000441711	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ARMC10-208	ENST00000441711	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ARMC10-208	ENST00000441711	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ARMC10-208	ENST00000441711	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ARMC10-208	ENST00000441711	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ARMC10-208	ENST00000441711	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ARMC10-208	ENST00000441711	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ARMC10-208	ENST00000441711	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	WDR62	O43379	1518 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ARMC10-208	ENST00000441711	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
ARMC10-208	ENST00000441711	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ARMC10-208	ENST00000441711	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ARMC10-208	ENST00000441711	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ARMC10-208	ENST00000441711	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
ARMC10-208	ENST00000441711	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.29	■■■□□ 2.76
ARMC10-208	ENST00000441711	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ARMC10-208	ENST00000441711	NAIP	Q13075	1403 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ARMC10-208	ENST00000441711	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ARMC10-208	ENST00000441711	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ARMC10-208	ENST00000441711	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ARMC10-208	ENST00000441711	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.2	■■■□□ 2.74
ARMC10-208	ENST00000441711	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ARMC10-208	ENST00000441711	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
ARMC10-208	ENST00000441711	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ARMC10-208	ENST00000441711	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ARMC10-208	ENST00000441711	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ARMC10-208	ENST00000441711	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.15	■■■□□ 2.74	8e-14	■■■■■ 56.3
ARMC10-208	ENST00000441711	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ARMC10-208	ENST00000441711	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.73
ARMC10-208	ENST00000441711	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
ARMC10-208	ENST00000441711	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ARMC10-208	ENST00000441711	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ARMC10-208	ENST00000441711	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ARMC10-208	ENST00000441711	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ARMC10-208	ENST00000441711	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARMC10-208	ENST00000441711	NBR1	Q14596	966 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ARMC10-208	ENST00000441711	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ARMC10-208	ENST00000441711	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ARMC10-208	ENST00000441711	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ARMC10-208	ENST00000441711	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ARMC10-208	ENST00000441711	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
ARMC10-208	ENST00000441711	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ARMC10-208	ENST00000441711	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
ARMC10-208	ENST00000441711	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.01	■■■□□ 2.72

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