RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 IGF1RP08069 1367 aa24.58■■□□□ 1.52
HCLS1-202ENST00000428394 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HCLS1-202ENST00000428394 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.53■■□□□ 1.52
HCLS1-202ENST00000428394 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.5■■□□□ 1.51
HCLS1-202ENST00000428394 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.49■■□□□ 1.51
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.49■■□□□ 1.51
HCLS1-202ENST00000428394 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
HCLS1-202ENST00000428394 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
HCLS1-202ENST00000428394 CUL7Q14999 1698 aa24.46■■□□□ 1.51
HCLS1-202ENST00000428394 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.45■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.44■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.43■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.42■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.41■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 MAPKBP1O60336 1514 aa24.41■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.4■■□□□ 1.5
HCLS1-202ENST00000428394 WDR62O43379 1518 aa24.39■■□□□ 1.49
HCLS1-202ENST00000428394 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.37■■□□□ 1.49
HCLS1-202ENST00000428394 TOPBP1Q92547 1522 aa24.37■■□□□ 1.49
HCLS1-202ENST00000428394 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
HCLS1-202ENST00000428394 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.35■■□□□ 1.49
HCLS1-202ENST00000428394 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.32■■□□□ 1.48
HCLS1-202ENST00000428394 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.25■■□□□ 1.47
HCLS1-202ENST00000428394 WDR97A6NE52 1622 aa24.24■■□□□ 1.47
HCLS1-202ENST00000428394 FMN1Q68DA7 1419 aa24.24■■□□□ 1.47
HCLS1-202ENST00000428394 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
HCLS1-202ENST00000428394 SAMD9Q5K651 1589 aa24.16■■□□□ 1.46
HCLS1-202ENST00000428394 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.11■■□□□ 1.45
HCLS1-202ENST00000428394 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.1■■□□□ 1.45
HCLS1-202ENST00000428394 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HCLS1-202ENST00000428394 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.08■■□□□ 1.45
HCLS1-202ENST00000428394 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.07■■□□□ 1.44
HCLS1-202ENST00000428394 IFT140Q96RY7 1462 aa24.06■■□□□ 1.44
HCLS1-202ENST00000428394 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.06■■□□□ 1.44
HCLS1-202ENST00000428394 HFM1A2PYH4 1435 aa24.05■■□□□ 1.44
HCLS1-202ENST00000428394 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HCLS1-202ENST00000428394 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.03■■□□□ 1.44
HCLS1-202ENST00000428394 ITGAEP38570 1179 aa24.03■■□□□ 1.44
HCLS1-202ENST00000428394 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
HCLS1-202ENST00000428394 UACAQ9BZF9 1416 aa24.01■■□□□ 1.43
HCLS1-202ENST00000428394 CCER2I3L3R5 266 aa23.99■■□□□ 1.43
HCLS1-202ENST00000428394 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
HCLS1-202ENST00000428394 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.99■■□□□ 1.43
HCLS1-202ENST00000428394 GRIN2BQ13224 1484 aa23.99■■□□□ 1.43
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.97■■□□□ 1.43
HCLS1-202ENST00000428394 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.95■■□□□ 1.43
HCLS1-202ENST00000428394 AKNAQ7Z591 1439 aa23.95■■□□□ 1.43
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGEF11O15085 1522 aa23.95■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.92■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.9■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.9■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.9■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.89■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
HCLS1-202ENST00000428394 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
HCLS1-202ENST00000428394 NCOA2Q15596 1464 aa23.89■■□□□ 1.41
HCLS1-202ENST00000428394 OSCARQ8IYS5 282 aa23.87■■□□□ 1.41
HCLS1-202ENST00000428394 HECW1Q76N89 1606 aa23.86■■□□□ 1.41
HCLS1-202ENST00000428394 TONSLQ96HA7 1378 aa23.86■■□□□ 1.41
HCLS1-202ENST00000428394 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
HCLS1-202ENST00000428394 NAIPQ13075 1403 aa23.84■■□□□ 1.41
HCLS1-202ENST00000428394 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.82■■□□□ 1.4
HCLS1-202ENST00000428394 PBRM1Q86U86 1689 aa23.82■■□□□ 1.4
HCLS1-202ENST00000428394 P3H3Q8IVL6 736 aa23.78■■□□□ 1.4
HCLS1-202ENST00000428394 MIA2Q96PC5 1412 aa23.78■■□□□ 1.4
HCLS1-202ENST00000428394 ANP32CO43423 234 aa23.78■■□□□ 1.4
HCLS1-202ENST00000428394 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
HCLS1-202ENST00000428394 PTPRKQ15262 1439 aa23.75■■□□□ 1.39
HCLS1-202ENST00000428394 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
HCLS1-202ENST00000428394 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.74■■□□□ 1.39
HCLS1-202ENST00000428394 IQGAP2Q13576 1575 aa23.71■■□□□ 1.39
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTS12P58397 1594 aa23.68■■□□□ 1.38
HCLS1-202ENST00000428394 NEFLP07196 543 aa23.67■■□□□ 1.38
HCLS1-202ENST00000428394 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.66■■□□□ 1.38
HCLS1-202ENST00000428394 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
HCLS1-202ENST00000428394 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.64■■□□□ 1.38
HCLS1-202ENST00000428394 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HCLS1-202ENST00000428394 ROCK1Q13464 1354 aa23.62■■□□□ 1.37
HCLS1-202ENST00000428394 KCNH8Q96L42 1107 aa23.61■■□□□ 1.37
HCLS1-202ENST00000428394 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
HCLS1-202ENST00000428394 SYNJ2O15056 1496 aa23.53■■□□□ 1.36
HCLS1-202ENST00000428394 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HCLS1-202ENST00000428394 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.52■■□□□ 1.36
HCLS1-202ENST00000428394 FKBP8Q14318 412 aa23.52■■□□□ 1.36
HCLS1-202ENST00000428394 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HCLS1-202ENST00000428394 CHD1O14646 1710 aa23.48■■□□□ 1.35
HCLS1-202ENST00000428394 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.47■■□□□ 1.35
HCLS1-202ENST00000428394 GRIN2AQ12879 1464 aa23.46■■□□□ 1.35
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA0556O60303 1618 aa23.45■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.44■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.43■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 DAPK1P53355 1430 aa23.42■■□□□ 1.34
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