RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.56□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.55□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.55□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.54□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 NCAPD3P42695 1498 aa9.54□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 CUX1P39880 1505 aa9.54□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.52□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.52□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.52□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.52□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.51□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.51□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 NGEFQ8N5V2 710 aa9.51□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.51□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.5□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.5□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 CUX2O14529 1486 aa9.49□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 KANK1Q14678 1352 aa9.48□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 MAP3K1Q13233 1512 aa9.47□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 PTMSP20962 102 aa9.46□□□□□ -0.89
ALMS1-201ENST00000423048 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.45□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 CFAP53Q96M91 514 aa9.43□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.43□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 BECN1Q14457 450 aa9.42□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 UACAQ9BZF9 1416 aa9.42□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 WIZO95785 1651 aa9.42□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.41□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 TMC1Q8TDI8 760 aa9.41□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.41□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.41□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.41□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 SOGA1O94964 1423 aa9.4□□□□□ -0.9
ALMS1-201ENST00000423048 PDE3BQ13370 1112 aa9.39□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 AAMPQ13685 434 aa9.38□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 RALBP1Q15311 655 aa9.37□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.37□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.36□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.36□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 ERCC6Q03468 1493 aa9.35□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 TOP2BQ02880 1626 aa9.35□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.35□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ALMS1-201ENST00000423048 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 CFTRP13569 1480 aa9.33□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 NUDCQ9Y266 331 aa9.33□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 MIA2Q96PC5 1412 aa9.33□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 MRS2Q9HD23 443 aa9.33□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.33□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.32□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.32□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 CUL7Q14999 1698 aa9.32□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 FBLN2P98095 1184 aa9.31□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 TMF1P82094 1093 aa9.31□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.31□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.31□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 CASC1Q6TDU7 716 aa9.3□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.3□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.3□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.29□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.28□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 FKBP8Q14318 412 aa9.28□□□□□ -0.92
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.27□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.27□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 P3H3Q8IVL6 736 aa9.26□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.26□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 WDR97A6NE52 1622 aa9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 PRXQ9BXM0 1461 aa9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 IFT140Q96RY7 1462 aa9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.25□□□□□ -0.93
ALMS1-201ENST00000423048 HECW1Q76N89 1606 aa9.24□□□□□ -0.93
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