RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409440.7

CERKL-205, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CERKL, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-205ENST00000409440 P3H3Q8IVL6 736 aa29.94■■■□□ 2.38
CERKL-205ENST00000409440 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.92■■■□□ 2.38
CERKL-205ENST00000409440 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CERKL-205ENST00000409440 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CERKL-205ENST00000409440 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.88■■■□□ 2.37
CERKL-205ENST00000409440 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.88■■■□□ 2.37
CERKL-205ENST00000409440 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
CERKL-205ENST00000409440 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.83■■■□□ 2.37
CERKL-205ENST00000409440 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.82■■■□□ 2.36
CERKL-205ENST00000409440 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.82■■■□□ 2.36
CERKL-205ENST00000409440 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.8■■■□□ 2.36
CERKL-205ENST00000409440 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.76■■■□□ 2.36
CERKL-205ENST00000409440 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
CERKL-205ENST00000409440 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.75■■■□□ 2.35
CERKL-205ENST00000409440 WDR97A6NE52 1622 aa29.75■■■□□ 2.35
CERKL-205ENST00000409440 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CERKL-205ENST00000409440 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.72■■■□□ 2.35
CERKL-205ENST00000409440 KCNH8Q96L42 1107 aa29.72■■■□□ 2.35
CERKL-205ENST00000409440 TOPBP1Q92547 1522 aa29.71■■■□□ 2.35
CERKL-205ENST00000409440 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.69■■■□□ 2.34
CERKL-205ENST00000409440 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.68■■■□□ 2.34
CERKL-205ENST00000409440 NESP48681 1621 aa29.64■■■□□ 2.34
CERKL-205ENST00000409440 CUL7Q14999 1698 aa29.64■■■□□ 2.33
CERKL-205ENST00000409440 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
CERKL-205ENST00000409440 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.63■■■□□ 2.33
CERKL-205ENST00000409440 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
CERKL-205ENST00000409440 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
CERKL-205ENST00000409440 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.57■■■□□ 2.32
CERKL-205ENST00000409440 MYT1Q01538 1121 aa29.56■■■□□ 2.32
CERKL-205ENST00000409440 FMN1Q68DA7 1419 aa29.54■■■□□ 2.32
CERKL-205ENST00000409440 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.54■■■□□ 2.32
CERKL-205ENST00000409440 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CERKL-205ENST00000409440 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.51■■■□□ 2.32
CERKL-205ENST00000409440 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CERKL-205ENST00000409440 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.48■■■□□ 2.31
CERKL-205ENST00000409440 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
CERKL-205ENST00000409440 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.43■■■□□ 2.3
CERKL-205ENST00000409440 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CERKL-205ENST00000409440 PTPRKQ15262 1439 aa29.43■■■□□ 2.3
CERKL-205ENST00000409440 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.4■■■□□ 2.3
CERKL-205ENST00000409440 SAMD9Q5K651 1589 aa29.39■■■□□ 2.3
CERKL-205ENST00000409440 HFM1A2PYH4 1435 aa29.38■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 TONSLQ96HA7 1378 aa29.37■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.36■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.36■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 NCOA2Q15596 1464 aa29.35■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 UACAQ9BZF9 1416 aa29.35■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.34■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.34■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 GRIN2BQ13224 1484 aa29.33■■■□□ 2.29
CERKL-205ENST00000409440 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.32■■■□□ 2.28
CERKL-205ENST00000409440 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.3■■■□□ 2.28
CERKL-205ENST00000409440 NAIPQ13075 1403 aa29.29■■■□□ 2.28
CERKL-205ENST00000409440 ANP32CO43423 234 aa29.29■■■□□ 2.28
CERKL-205ENST00000409440 CCER2I3L3R5 266 aa29.27■■■□□ 2.28
CERKL-205ENST00000409440 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CERKL-205ENST00000409440 BCANQ96GW7 911 aa29.26■■■□□ 2.27
CERKL-205ENST00000409440 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CERKL-205ENST00000409440 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.24■■■□□ 2.27
CERKL-205ENST00000409440 FKBP8Q14318 412 aa29.23■■■□□ 2.27
CERKL-205ENST00000409440 TRIM52Q96A61 297 aa29.2■■■□□ 2.27
CERKL-205ENST00000409440 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.18■■■□□ 2.26
CERKL-205ENST00000409440 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.18■■■□□ 2.26
CERKL-205ENST00000409440 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.16■■■□□ 2.26
CERKL-205ENST00000409440 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.14■■■□□ 2.26
CERKL-205ENST00000409440 ARHGEF11O15085 1522 aa29.14■■■□□ 2.25
CERKL-205ENST00000409440 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.13■■■□□ 2.25
CERKL-205ENST00000409440 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.12■■■□□ 2.25
CERKL-205ENST00000409440 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.12■■■□□ 2.25
CERKL-205ENST00000409440 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.09■■■□□ 2.25
CERKL-205ENST00000409440 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.24
CERKL-205ENST00000409440 NEFLP07196 543 aa29.06■■■□□ 2.24
CERKL-205ENST00000409440 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CERKL-205ENST00000409440 HECW1Q76N89 1606 aa29.03■■■□□ 2.24
CERKL-205ENST00000409440 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.02■■■□□ 2.24
CERKL-205ENST00000409440 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
CERKL-205ENST00000409440 KDM6BO15054 1643 aa29■■■□□ 2.23
CERKL-205ENST00000409440 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CERKL-205ENST00000409440 PBRM1Q86U86 1689 aa28.98■■■□□ 2.23
CERKL-205ENST00000409440 IQGAP2Q13576 1575 aa28.98■■■□□ 2.23
CERKL-205ENST00000409440 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CERKL-205ENST00000409440 ARID3CA6NKF2 412 aa28.96■■■□□ 2.23
CERKL-205ENST00000409440 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CERKL-205ENST00000409440 AKNAQ7Z591 1439 aa28.94■■■□□ 2.22
CERKL-205ENST00000409440 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.93■■■□□ 2.22
CERKL-205ENST00000409440 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.9■■■□□ 2.22
CERKL-205ENST00000409440 MIA2Q96PC5 1412 aa28.9■■■□□ 2.22
CERKL-205ENST00000409440 ADAMTS12P58397 1594 aa28.89■■■□□ 2.22
CERKL-205ENST00000409440 WDR62O43379 1518 aa28.88■■■□□ 2.21
CERKL-205ENST00000409440 FOXD1Q16676 465 aa28.86■■■□□ 2.21
CERKL-205ENST00000409440 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
CERKL-205ENST00000409440 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
CERKL-205ENST00000409440 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.83■■■□□ 2.21
CERKL-205ENST00000409440 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.77■■■□□ 2.2
CERKL-205ENST00000409440 DAPK1P53355 1430 aa28.75■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.75■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms