RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-206ENST00000405546 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-206ENST00000405546 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-206ENST00000405546 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-206ENST00000405546 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-206ENST00000405546 ARID3CA6NKF2 412 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-206ENST00000405546 FKBP8Q14318 412 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-206ENST00000405546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-206ENST00000405546 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-206ENST00000405546 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-206ENST00000405546 NESP48681 1621 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-206ENST00000405546 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ATG4B-206ENST00000405546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-206ENST00000405546 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-206ENST00000405546 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-206ENST00000405546 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-206ENST00000405546 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-206ENST00000405546 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.35■■□□□ 1.01
ATG4B-206ENST00000405546 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-206ENST00000405546 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.31■■□□□ 1
ATG4B-206ENST00000405546 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.31■■□□□ 1
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM52Q96A61 297 aa21.29■■□□□ 1
ATG4B-206ENST00000405546 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
ATG4B-206ENST00000405546 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
ATG4B-206ENST00000405546 TIAM1Q13009 1591 aa21.25■□□□□ 0.99
ATG4B-206ENST00000405546 TOPBP1Q92547 1522 aa21.24■□□□□ 0.99
ATG4B-206ENST00000405546 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.22■□□□□ 0.99
ATG4B-206ENST00000405546 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
ATG4B-206ENST00000405546 NEFLP07196 543 aa21.18■□□□□ 0.98
ATG4B-206ENST00000405546 TONSLQ96HA7 1378 aa21.16■□□□□ 0.98
ATG4B-206ENST00000405546 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.13■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 MSH5O43196 834 aa21.12■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.12■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 FMN1Q68DA7 1419 aa21.11■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.1■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 ANP32CO43423 234 aa21.1■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 FBLN2P98095 1184 aa21.08■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.08■□□□□ 0.97
ATG4B-206ENST00000405546 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.07■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.07■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 MAPKBP1O60336 1514 aa21.07■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 PRDM2Q13029 1718 aa21.06■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 MAP3K1Q13233 1512 aa21.04■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.03■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 WDR97A6NE52 1622 aa21.03■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.03■□□□□ 0.96
ATG4B-206ENST00000405546 FOXD1Q16676 465 aa21.01■□□□□ 0.95
ATG4B-206ENST00000405546 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.953e-7■■■■□ 19.9
ATG4B-206ENST00000405546 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-206ENST00000405546 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-206ENST00000405546 PTPRKQ15262 1439 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-206ENST00000405546 NCOA2Q15596 1464 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-206ENST00000405546 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-206ENST00000405546 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-206ENST00000405546 CUL7Q14999 1698 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-206ENST00000405546 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-206ENST00000405546 NBR1Q14596 966 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-206ENST00000405546 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.84■□□□□ 0.93
ATG4B-206ENST00000405546 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ATG4B-206ENST00000405546 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.83■□□□□ 0.93
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.83■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 UACAQ9BZF9 1416 aa20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 NAIPQ13075 1403 aa20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.925e-9■■■■□ 24.7
ATG4B-206ENST00000405546 HFM1A2PYH4 1435 aa20.81■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.79■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ATG4B-206ENST00000405546 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
ATG4B-206ENST00000405546 GRIN2BQ13224 1484 aa20.74■□□□□ 0.91
ATG4B-206ENST00000405546 CCER2I3L3R5 266 aa20.73■□□□□ 0.91
ATG4B-206ENST00000405546 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
ATG4B-206ENST00000405546 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.73■□□□□ 0.91
ATG4B-206ENST00000405546 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.73■□□□□ 0.91
ATG4B-206ENST00000405546 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.7■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.68■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.68■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.68■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.67■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.66■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.65■□□□□ 0.9
ATG4B-206ENST00000405546 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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