RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.11■■□□□ 1.61
NOMO3-202ENST00000399336 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
NOMO3-202ENST00000399336 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NOMO3-202ENST00000399336 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.07■■□□□ 1.6
NOMO3-202ENST00000399336 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
NOMO3-202ENST00000399336 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.03■■□□□ 1.6
NOMO3-202ENST00000399336 TSPY4P0CV99 314 aa25.02■■□□□ 1.6
NOMO3-202ENST00000399336 TSPY10P0CW01 314 aa25.02■■□□□ 1.6
NOMO3-202ENST00000399336 SMARCA4P51532 1647 aa25.01■■□□□ 1.59
NOMO3-202ENST00000399336 TMC1Q8TDI8 760 aa25■■□□□ 1.59
NOMO3-202ENST00000399336 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.97■■□□□ 1.59
NOMO3-202ENST00000399336 SMARCA2P51531 1590 aa24.96■■□□□ 1.59
NOMO3-202ENST00000399336 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.93■■□□□ 1.58
NOMO3-202ENST00000399336 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NOMO3-202ENST00000399336 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NOMO3-202ENST00000399336 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.9■■□□□ 1.58
NOMO3-202ENST00000399336 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NOMO3-202ENST00000399336 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.87■■□□□ 1.57
NOMO3-202ENST00000399336 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.84■■□□□ 1.57
NOMO3-202ENST00000399336 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
NOMO3-202ENST00000399336 RGL3Q3MIN7 710 aa24.83■■□□□ 1.56
NOMO3-202ENST00000399336 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.82■■□□□ 1.56
NOMO3-202ENST00000399336 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
NOMO3-202ENST00000399336 BCL11AQ9H165 835 aa24.81■■□□□ 1.56
NOMO3-202ENST00000399336 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NOMO3-202ENST00000399336 KCNH8Q96L42 1107 aa24.77■■□□□ 1.56
NOMO3-202ENST00000399336 FOXD1Q16676 465 aa24.76■■□□□ 1.55
NOMO3-202ENST00000399336 NBR1Q14596 966 aa24.76■■□□□ 1.55
NOMO3-202ENST00000399336 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NOMO3-202ENST00000399336 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.72■■□□□ 1.55
NOMO3-202ENST00000399336 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.7■■□□□ 1.54
NOMO3-202ENST00000399336 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.7■■□□□ 1.54
NOMO3-202ENST00000399336 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NOMO3-202ENST00000399336 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.69■■□□□ 1.54
NOMO3-202ENST00000399336 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NOMO3-202ENST00000399336 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.66■■□□□ 1.54
NOMO3-202ENST00000399336 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NOMO3-202ENST00000399336 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NOMO3-202ENST00000399336 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.62■■□□□ 1.53
NOMO3-202ENST00000399336 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
NOMO3-202ENST00000399336 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
NOMO3-202ENST00000399336 CCER2I3L3R5 266 aa24.56■■□□□ 1.52
NOMO3-202ENST00000399336 FMN1Q68DA7 1419 aa24.53■■□□□ 1.52
NOMO3-202ENST00000399336 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.52■■□□□ 1.52
NOMO3-202ENST00000399336 IGF1RP08069 1367 aa24.52■■□□□ 1.52
NOMO3-202ENST00000399336 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
NOMO3-202ENST00000399336 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.5■■□□□ 1.51
NOMO3-202ENST00000399336 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.49■■□□□ 1.51
NOMO3-202ENST00000399336 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
NOMO3-202ENST00000399336 KIF21BO75037 1637 aa24.47■■□□□ 1.51
NOMO3-202ENST00000399336 NEFMP07197 916 aa24.46■■□□□ 1.51
NOMO3-202ENST00000399336 PKD2Q13563 968 aa24.46■■□□□ 1.51
NOMO3-202ENST00000399336 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.46■■□□□ 1.51
NOMO3-202ENST00000399336 SLC24A1O60721 1099 aa24.43■■□□□ 1.5
NOMO3-202ENST00000399336 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.43■■□□□ 1.5
NOMO3-202ENST00000399336 SYNJ1O43426 1573 aa24.42■■□□□ 1.5
NOMO3-202ENST00000399336 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.41■■□□□ 1.5
NOMO3-202ENST00000399336 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.41■■□□□ 1.5
NOMO3-202ENST00000399336 ERCC6Q03468 1493 aa24.39■■□□□ 1.5
NOMO3-202ENST00000399336 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.36■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 ARAP1Q96P48 1450 aa24.34■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.33■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.33■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.33■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.33■■□□□ 1.49
NOMO3-202ENST00000399336 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.32■■□□□ 1.48
NOMO3-202ENST00000399336 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.3■■□□□ 1.48
NOMO3-202ENST00000399336 ARXQ96QS3 562 aa24.27■■□□□ 1.48
NOMO3-202ENST00000399336 NCAPD3P42695 1498 aa24.27■■□□□ 1.48
NOMO3-202ENST00000399336 NUP155O75694 1391 aa24.25■■□□□ 1.47
NOMO3-202ENST00000399336 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NOMO3-202ENST00000399336 NEUROD2Q15784 382 aa24.23■■□□□ 1.47
NOMO3-202ENST00000399336 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NOMO3-202ENST00000399336 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
NOMO3-202ENST00000399336 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
NOMO3-202ENST00000399336 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NOMO3-202ENST00000399336 PRXQ9BXM0 1461 aa24.18■■□□□ 1.46
NOMO3-202ENST00000399336 CDCA8Q53HL2 280 aa24.17■■□□□ 1.46
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.16■■□□□ 1.46
NOMO3-202ENST00000399336 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.15■■□□□ 1.46
NOMO3-202ENST00000399336 TMF1P82094 1093 aa24.14■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 JPH4Q96JJ6 628 aa24.13■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.12■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.11■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 CFTRP13569 1480 aa24.1■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.1■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 RGS3P49796 1198 aa24.08■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NOMO3-202ENST00000399336 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.07■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.05■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 CUX1P39880 1505 aa24.04■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.04■■□□□ 1.44
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