RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397425.5

NFS1-204, Transcript of NFS1, cysteine desulfurase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NFS1, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFS1-204ENST00000397425 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.8■■■□□ 2.52
NFS1-204ENST00000397425 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.79■■■□□ 2.52
NFS1-204ENST00000397425 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
NFS1-204ENST00000397425 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.75■■■□□ 2.51
NFS1-204ENST00000397425 MAPKBP1O60336 1514 aa30.74■■■□□ 2.51
NFS1-204ENST00000397425 CUL7Q14999 1698 aa30.74■■■□□ 2.51
NFS1-204ENST00000397425 ITGAEP38570 1179 aa30.74■■■□□ 2.51
NFS1-204ENST00000397425 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.73■■■□□ 2.51
NFS1-204ENST00000397425 TOPBP1Q92547 1522 aa30.72■■■□□ 2.51
NFS1-204ENST00000397425 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.72■■■□□ 2.51
NFS1-204ENST00000397425 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.7■■■□□ 2.5
NFS1-204ENST00000397425 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
NFS1-204ENST00000397425 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.54e-6■■■□□ 17.2
NFS1-204ENST00000397425 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.67■■■□□ 2.5
NFS1-204ENST00000397425 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.67■■■□□ 2.5
NFS1-204ENST00000397425 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.63■■■□□ 2.49
NFS1-204ENST00000397425 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.6■■■□□ 2.49
NFS1-204ENST00000397425 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.58■■■□□ 2.49
NFS1-204ENST00000397425 WDR97A6NE52 1622 aa30.57■■■□□ 2.48
NFS1-204ENST00000397425 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
NFS1-204ENST00000397425 P3H3Q8IVL6 736 aa30.53■■■□□ 2.48
NFS1-204ENST00000397425 NESP48681 1621 aa30.51■■■□□ 2.48
NFS1-204ENST00000397425 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.5■■■□□ 2.47
NFS1-204ENST00000397425 FMN1Q68DA7 1419 aa30.5■■■□□ 2.47
NFS1-204ENST00000397425 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.46■■■□□ 2.47
NFS1-204ENST00000397425 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
NFS1-204ENST00000397425 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.43■■■□□ 2.46
NFS1-204ENST00000397425 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.43■■■□□ 2.46
NFS1-204ENST00000397425 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
NFS1-204ENST00000397425 SAMD9Q5K651 1589 aa30.41■■■□□ 2.46
NFS1-204ENST00000397425 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.38■■■□□ 2.45
NFS1-204ENST00000397425 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
NFS1-204ENST00000397425 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.32■■■□□ 2.44
NFS1-204ENST00000397425 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.29■■■□□ 2.44
NFS1-204ENST00000397425 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.28■■■□□ 2.44
NFS1-204ENST00000397425 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.27■■■□□ 2.44
NFS1-204ENST00000397425 GRIN2BQ13224 1484 aa30.27■■■□□ 2.44
NFS1-204ENST00000397425 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.27■■■□□ 2.44
NFS1-204ENST00000397425 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.24■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 HFM1A2PYH4 1435 aa30.23■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.22■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.2■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.2■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
NFS1-204ENST00000397425 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.19■■■□□ 2.42
NFS1-204ENST00000397425 NCOA2Q15596 1464 aa30.18■■■□□ 2.42
NFS1-204ENST00000397425 UACAQ9BZF9 1416 aa30.17■■■□□ 2.42
NFS1-204ENST00000397425 PTPRKQ15262 1439 aa30.14■■■□□ 2.42
NFS1-204ENST00000397425 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
NFS1-204ENST00000397425 MYT1Q01538 1121 aa30.12■■■□□ 2.41
NFS1-204ENST00000397425 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
NFS1-204ENST00000397425 ARHGEF11O15085 1522 aa30.1■■■□□ 2.41
NFS1-204ENST00000397425 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.1■■■□□ 2.41
NFS1-204ENST00000397425 NAIPQ13075 1403 aa30.08■■■□□ 2.41
NFS1-204ENST00000397425 TONSLQ96HA7 1378 aa30.07■■■□□ 2.4
NFS1-204ENST00000397425 KCNH8Q96L42 1107 aa30.06■■■□□ 2.4
NFS1-204ENST00000397425 PBRM1Q86U86 1689 aa30.03■■■□□ 2.4
NFS1-204ENST00000397425 HECW1Q76N89 1606 aa30.03■■■□□ 2.4
NFS1-204ENST00000397425 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
NFS1-204ENST00000397425 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.99■■■□□ 2.39
NFS1-204ENST00000397425 CCER2I3L3R5 266 aa29.99■■■□□ 2.39
NFS1-204ENST00000397425 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.98■■■□□ 2.39
NFS1-204ENST00000397425 IQGAP2Q13576 1575 aa29.96■■■□□ 2.39
NFS1-204ENST00000397425 AKNAQ7Z591 1439 aa29.93■■■□□ 2.38
NFS1-204ENST00000397425 ADAMTS12P58397 1594 aa29.93■■■□□ 2.38
NFS1-204ENST00000397425 ANP32CO43423 234 aa29.9■■■□□ 2.38
NFS1-204ENST00000397425 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.9■■■□□ 2.38
NFS1-204ENST00000397425 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
NFS1-204ENST00000397425 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
NFS1-204ENST00000397425 MIA2Q96PC5 1412 aa29.85■■■□□ 2.37
NFS1-204ENST00000397425 WDR62O43379 1518 aa29.84■■■□□ 2.37
NFS1-204ENST00000397425 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.79■■■□□ 2.36
NFS1-204ENST00000397425 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.78■■■□□ 2.36
NFS1-204ENST00000397425 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
NFS1-204ENST00000397425 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
NFS1-204ENST00000397425 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.74■■■□□ 2.35
NFS1-204ENST00000397425 KDM6BO15054 1643 aa29.72■■■□□ 2.35
NFS1-204ENST00000397425 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.69■■■□□ 2.34
NFS1-204ENST00000397425 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.68■■■□□ 2.34
NFS1-204ENST00000397425 IFT140Q96RY7 1462 aa29.65■■■□□ 2.34
NFS1-204ENST00000397425 FKBP8Q14318 412 aa29.64■■■□□ 2.34
NFS1-204ENST00000397425 TRIM52Q96A61 297 aa29.64■■■□□ 2.34
NFS1-204ENST00000397425 ROCK1Q13464 1354 aa29.64■■■□□ 2.34
NFS1-204ENST00000397425 KIAA0556O60303 1618 aa29.64■■■□□ 2.33
NFS1-204ENST00000397425 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.62■■■□□ 2.33
NFS1-204ENST00000397425 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
NFS1-204ENST00000397425 NEFLP07196 543 aa29.61■■■□□ 2.33
NFS1-204ENST00000397425 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.61■■■□□ 2.33
NFS1-204ENST00000397425 DAPK1P53355 1430 aa29.59■■■□□ 2.33
NFS1-204ENST00000397425 DISP1Q96F81 1524 aa29.58■■■□□ 2.33
NFS1-204ENST00000397425 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
NFS1-204ENST00000397425 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.56■■■□□ 2.32
NFS1-204ENST00000397425 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
NFS1-204ENST00000397425 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
NFS1-204ENST00000397425 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.53■■■□□ 2.32
NFS1-204ENST00000397425 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
NFS1-204ENST00000397425 ABCC5O15440 1437 aa29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms