RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379388.6

HIVEP1-201, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-201ENST00000379388 TMC1Q8TDI8 760 aa16.21■□□□□ 0.19
HIVEP1-201ENST00000379388 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
HIVEP1-201ENST00000379388 CLIP1P30622 1438 aa16.18■□□□□ 0.18
HIVEP1-201ENST00000379388 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HIVEP1-201ENST00000379388 ARXQ96QS3 562 aa16.14■□□□□ 0.17
HIVEP1-201ENST00000379388 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
HIVEP1-201ENST00000379388 KIF27Q86VH2 1401 aa16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1-201ENST00000379388 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
HIVEP1-201ENST00000379388 GGT6Q6P531 493 aa16.07■□□□□ 0.16
HIVEP1-201ENST00000379388 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.06■□□□□ 0.16
HIVEP1-201ENST00000379388 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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HIVEP1-201ENST00000379388 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
HIVEP1-201ENST00000379388 SOX12O15370 315 aa16.04■□□□□ 0.16
HIVEP1-201ENST00000379388 CUX2O14529 1486 aa16.03■□□□□ 0.16
HIVEP1-201ENST00000379388 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
HIVEP1-201ENST00000379388 POGKQ9P215 609 aa16.01■□□□□ 0.15
HIVEP1-201ENST00000379388 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16■□□□□ 0.15
HIVEP1-201ENST00000379388 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HIVEP1-201ENST00000379388 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HIVEP1-201ENST00000379388 GOLGA3Q08378 1498 aa15.98■□□□□ 0.15
HIVEP1-201ENST00000379388 CEP162Q5TB80 1403 aa15.98■□□□□ 0.15
HIVEP1-201ENST00000379388 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.97■□□□□ 0.15
HIVEP1-201ENST00000379388 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.97■□□□□ 0.15
HIVEP1-201ENST00000379388 MRS2Q9HD23 443 aa15.95■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.94■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 STK26Q9P289 416 aa15.93■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 NEUROD2Q15784 382 aa15.91■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.91■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 SOGA1O94964 1423 aa15.91■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.91■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.91■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 FKBP8Q14318 412 aa15.9■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HIVEP1-201ENST00000379388 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.89■□□□□ 0.13
HIVEP1-201ENST00000379388 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HIVEP1-201ENST00000379388 FOXD1Q16676 465 aa15.86■□□□□ 0.13
HIVEP1-201ENST00000379388 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.86■□□□□ 0.13
HIVEP1-201ENST00000379388 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.83■□□□□ 0.13
HIVEP1-201ENST00000379388 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.83■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 NPHP1O15259 732 aa15.82■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 ABCC8Q09428 1581 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 22.7
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HIVEP1-201ENST00000379388 EEA1Q15075 1411 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
HIVEP1-201ENST00000379388 NUTM2FA1L443 756 aa15.76■□□□□ 0.11
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HIVEP1-201ENST00000379388 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 KIF3BO15066 747 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 JPH4Q96JJ6 628 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 KANK1Q14678 1352 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 CFAP53Q96M91 514 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 MIER1Q8N108 512 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.71■□□□□ 0.11
HIVEP1-201ENST00000379388 SMARCA2P51531 1590 aa15.71■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.71■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.7■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 OSCARQ8IYS5 282 aa15.7■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 PKD2Q13563 968 aa15.7■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.7■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.67■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.66■□□□□ 0.1
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HIVEP1-201ENST00000379388 CDCA8Q53HL2 280 aa15.66■□□□□ 0.1
HIVEP1-201ENST00000379388 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.62■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.61■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 NUDCQ9Y266 331 aa15.61■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 WIZO95785 1651 aa15.61■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.6■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.6■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.6■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
HIVEP1-201ENST00000379388 TMF1P82094 1093 aa15.58■□□□□ 0.08
HIVEP1-201ENST00000379388 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.57■□□□□ 0.08
HIVEP1-201ENST00000379388 NUP155O75694 1391 aa15.56■□□□□ 0.08
HIVEP1-201ENST00000379388 EID1Q9Y6B2 187 aa15.56■□□□□ 0.08
HIVEP1-201ENST00000379388 MORC1Q86VD1 984 aa15.56■□□□□ 0.08
HIVEP1-201ENST00000379388 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
HIVEP1-201ENST00000379388 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.55■□□□□ 0.08
HIVEP1-201ENST00000379388 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
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