RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376180.7

ITGBL1-202, Transcript of integrin subunit beta like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGBL1, Length 2,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGBL1-202ENST00000376180 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.97■■■□□ 2.07
ITGBL1-202ENST00000376180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.95■■■□□ 2.06
ITGBL1-202ENST00000376180 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ITGBL1-202ENST00000376180 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.94■■■□□ 2.06
ITGBL1-202ENST00000376180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.94■■■□□ 2.06
ITGBL1-202ENST00000376180 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.92■■■□□ 2.06
ITGBL1-202ENST00000376180 P3H3Q8IVL6 736 aa27.92■■■□□ 2.06
ITGBL1-202ENST00000376180 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.91■■■□□ 2.06
ITGBL1-202ENST00000376180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.87■■■□□ 2.05
ITGBL1-202ENST00000376180 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
ITGBL1-202ENST00000376180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.84■■■□□ 2.05
ITGBL1-202ENST00000376180 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.84■■■□□ 2.05
ITGBL1-202ENST00000376180 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.84■■■□□ 2.05
ITGBL1-202ENST00000376180 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.82■■■□□ 2.04
ITGBL1-202ENST00000376180 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
ITGBL1-202ENST00000376180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
ITGBL1-202ENST00000376180 TOPBP1Q92547 1522 aa27.79■■■□□ 2.04
ITGBL1-202ENST00000376180 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.76■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.75■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.75■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.75■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 WDR97A6NE52 1622 aa27.74■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 NESP48681 1621 aa27.73■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.73■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CUL7Q14999 1698 aa27.72■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.72■■■□□ 2.03
ITGBL1-202ENST00000376180 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.02
ITGBL1-202ENST00000376180 KCNH8Q96L42 1107 aa27.66■■■□□ 2.02
ITGBL1-202ENST00000376180 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
ITGBL1-202ENST00000376180 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.59■■■□□ 2.01
ITGBL1-202ENST00000376180 FMN1Q68DA7 1419 aa27.57■■■□□ 2
ITGBL1-202ENST00000376180 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.56■■■□□ 2
ITGBL1-202ENST00000376180 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ITGBL1-202ENST00000376180 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
ITGBL1-202ENST00000376180 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.54■■■□□ 2
ITGBL1-202ENST00000376180 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.53■■■□□ 2
ITGBL1-202ENST00000376180 BCANQ96GW7 911 aa27.5■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 SAMD9Q5K651 1589 aa27.49■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.49■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.48■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 PTPRKQ15262 1439 aa27.47■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.47■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.45■■□□□ 1.99
ITGBL1-202ENST00000376180 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.42■■□□□ 1.98
ITGBL1-202ENST00000376180 FKBP8Q14318 412 aa27.42■■□□□ 1.98
ITGBL1-202ENST00000376180 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.41■■□□□ 1.98
ITGBL1-202ENST00000376180 GRIN2BQ13224 1484 aa27.41■■□□□ 1.98
ITGBL1-202ENST00000376180 HFM1A2PYH4 1435 aa27.41■■□□□ 1.98
ITGBL1-202ENST00000376180 BCL11AQ9H165 835 aa27.41■■□□□ 1.98
ITGBL1-202ENST00000376180 NCOA2Q15596 1464 aa27.39■■□□□ 1.98
ITGBL1-202ENST00000376180 UACAQ9BZF9 1416 aa27.37■■□□□ 1.97
ITGBL1-202ENST00000376180 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.36■■□□□ 1.97
ITGBL1-202ENST00000376180 TONSLQ96HA7 1378 aa27.35■■□□□ 1.97
ITGBL1-202ENST00000376180 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ITGBL1-202ENST00000376180 NAIPQ13075 1403 aa27.33■■□□□ 1.97
ITGBL1-202ENST00000376180 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ITGBL1-202ENST00000376180 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.31■■□□□ 1.96
ITGBL1-202ENST00000376180 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.27■■□□□ 1.96
ITGBL1-202ENST00000376180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.27■■□□□ 1.96
ITGBL1-202ENST00000376180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.26■■□□□ 1.96
ITGBL1-202ENST00000376180 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.26■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 NEFLP07196 543 aa27.25■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 ARHGEF11O15085 1522 aa27.24■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 CCER2I3L3R5 266 aa27.24■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 ANP32CO43423 234 aa27.24■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.23■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.2■■□□□ 1.95
ITGBL1-202ENST00000376180 TRIM52Q96A61 297 aa27.15■■□□□ 1.94
ITGBL1-202ENST00000376180 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.15■■□□□ 1.94
ITGBL1-202ENST00000376180 PBRM1Q86U86 1689 aa27.14■■□□□ 1.94
ITGBL1-202ENST00000376180 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
ITGBL1-202ENST00000376180 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.13■■□□□ 1.93
ITGBL1-202ENST00000376180 HECW1Q76N89 1606 aa27.13■■□□□ 1.93
ITGBL1-202ENST00000376180 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.13■■□□□ 1.93
ITGBL1-202ENST00000376180 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM6BO15054 1643 aa27.09■■□□□ 1.93
ITGBL1-202ENST00000376180 IQGAP2Q13576 1575 aa27.09■■□□□ 1.93
ITGBL1-202ENST00000376180 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ITGBL1-202ENST00000376180 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
ITGBL1-202ENST00000376180 ADAMTS12P58397 1594 aa27.04■■□□□ 1.92
ITGBL1-202ENST00000376180 AKNAQ7Z591 1439 aa27.01■■□□□ 1.92
ITGBL1-202ENST00000376180 WDR62O43379 1518 aa27■■□□□ 1.91
ITGBL1-202ENST00000376180 ARID3CA6NKF2 412 aa26.99■■□□□ 1.91
ITGBL1-202ENST00000376180 MIA2Q96PC5 1412 aa26.98■■□□□ 1.91
ITGBL1-202ENST00000376180 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
ITGBL1-202ENST00000376180 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.96■■□□□ 1.91
ITGBL1-202ENST00000376180 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.94■■□□□ 1.9
ITGBL1-202ENST00000376180 MSH5O43196 834 aa26.93■■□□□ 1.9
ITGBL1-202ENST00000376180 FOXD1Q16676 465 aa26.9■■□□□ 1.9
ITGBL1-202ENST00000376180 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.87■■□□□ 1.89
ITGBL1-202ENST00000376180 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.86■■□□□ 1.89
ITGBL1-202ENST00000376180 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
ITGBL1-202ENST00000376180 DAPK1P53355 1430 aa26.84■■□□□ 1.89
ITGBL1-202ENST00000376180 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms