RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372621.8

CTPS1-202, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-202ENST00000372621 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.62■□□□□ 0.57
CTPS1-202ENST00000372621 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.62■□□□□ 0.57
CTPS1-202ENST00000372621 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CTPS1-202ENST00000372621 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.61■□□□□ 0.57
CTPS1-202ENST00000372621 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.6■□□□□ 0.57
CTPS1-202ENST00000372621 ITGAEP38570 1179 aa18.57■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 TOPBP1Q92547 1522 aa18.56■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.56■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.56■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.55■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 CUL7Q14999 1698 aa18.55■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.53■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.53■□□□□ 0.56
CTPS1-202ENST00000372621 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 28.2
CTPS1-202ENST00000372621 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-202ENST00000372621 WDR97A6NE52 1622 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-202ENST00000372621 NESP48681 1621 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-202ENST00000372621 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-202ENST00000372621 P3H3Q8IVL6 736 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-202ENST00000372621 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CTPS1-202ENST00000372621 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.42■□□□□ 0.54
CTPS1-202ENST00000372621 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.41■□□□□ 0.54
CTPS1-202ENST00000372621 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CTPS1-202ENST00000372621 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.4■□□□□ 0.54
CTPS1-202ENST00000372621 FMN1Q68DA7 1419 aa18.39■□□□□ 0.54
CTPS1-202ENST00000372621 SAMD9Q5K651 1589 aa18.39■□□□□ 0.53
CTPS1-202ENST00000372621 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.37■□□□□ 0.53
CTPS1-202ENST00000372621 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.37■□□□□ 0.53
CTPS1-202ENST00000372621 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.36■□□□□ 0.53
CTPS1-202ENST00000372621 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTPS1-202ENST00000372621 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.35■□□□□ 0.53
CTPS1-202ENST00000372621 GRIN2BQ13224 1484 aa18.3■□□□□ 0.52
CTPS1-202ENST00000372621 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CTPS1-202ENST00000372621 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.29■□□□□ 0.52
CTPS1-202ENST00000372621 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTPS1-202ENST00000372621 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CTPS1-202ENST00000372621 PTPRKQ15262 1439 aa18.27■□□□□ 0.52
CTPS1-202ENST00000372621 HFM1A2PYH4 1435 aa18.27■□□□□ 0.52
CTPS1-202ENST00000372621 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.26■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 KCNH8Q96L42 1107 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 NCOA2Q15596 1464 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 UACAQ9BZF9 1416 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 ARHGEF11O15085 1522 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-202ENST00000372621 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CTPS1-202ENST00000372621 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.2■□□□□ 0.5
CTPS1-202ENST00000372621 NAIPQ13075 1403 aa18.2■□□□□ 0.5
CTPS1-202ENST00000372621 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.18■□□□□ 0.5
CTPS1-202ENST00000372621 PBRM1Q86U86 1689 aa18.15■□□□□ 0.5
CTPS1-202ENST00000372621 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.14■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 TONSLQ96HA7 1378 aa18.13■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.11■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 HECW1Q76N89 1606 aa18.11■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 CCER2I3L3R5 266 aa18.1■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.1■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 MYT1Q01538 1121 aa18.09■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 IQGAP2Q13576 1575 aa18.09■□□□□ 0.49
CTPS1-202ENST00000372621 ADAMTS12P58397 1594 aa18.08■□□□□ 0.48
CTPS1-202ENST00000372621 AKNAQ7Z591 1439 aa18.06■□□□□ 0.48
CTPS1-202ENST00000372621 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CTPS1-202ENST00000372621 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTPS1-202ENST00000372621 WDR62O43379 1518 aa18.03■□□□□ 0.48
CTPS1-202ENST00000372621 ANP32CO43423 234 aa18.02■□□□□ 0.48
CTPS1-202ENST00000372621 KDM6BO15054 1643 aa18.02■□□□□ 0.47
CTPS1-202ENST00000372621 MIA2Q96PC5 1412 aa18.02■□□□□ 0.47
CTPS1-202ENST00000372621 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CTPS1-202ENST00000372621 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa17.98■□□□□ 0.47
CTPS1-202ENST00000372621 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.97■□□□□ 0.47
CTPS1-202ENST00000372621 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.97■□□□□ 0.47
CTPS1-202ENST00000372621 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.94■□□□□ 0.46
CTPS1-202ENST00000372621 FKBP8Q14318 412 aa17.91■□□□□ 0.46
CTPS1-202ENST00000372621 KIAA0556O60303 1618 aa17.91■□□□□ 0.46
CTPS1-202ENST00000372621 DISP1Q96F81 1524 aa17.9■□□□□ 0.46
CTPS1-202ENST00000372621 TRIM52Q96A61 297 aa17.9■□□□□ 0.46
CTPS1-202ENST00000372621 ROCK1Q13464 1354 aa17.89■□□□□ 0.46
CTPS1-202ENST00000372621 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.89■□□□□ 0.46
CTPS1-202ENST00000372621 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 IFT140Q96RY7 1462 aa17.88■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.88■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.88■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 DAPK1P53355 1430 aa17.88■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 ABCC5O15440 1437 aa17.85■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.85■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 BCANQ96GW7 911 aa17.85■□□□□ 0.45
CTPS1-202ENST00000372621 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.83■□□□□ 0.45
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