RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368815.6

EDRF1-205, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EDRF1, Length 4,123 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-205ENST00000368815 ITGAEP38570 1179 aa16.18■□□□□ 0.18
EDRF1-205ENST00000368815 ARID3CA6NKF2 412 aa16.17■□□□□ 0.18
EDRF1-205ENST00000368815 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
EDRF1-205ENST00000368815 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.14■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 HRCP23327 699 aa16.13■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 EEA1Q15075 1411 aa16.13■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.13■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 GRIN2AQ12879 1464 aa16.12■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.1■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.09■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.07■□□□□ 0.16
EDRF1-205ENST00000368815 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
EDRF1-205ENST00000368815 WDR97A6NE52 1622 aa16.06■□□□□ 0.16
EDRF1-205ENST00000368815 PTPRGP23470 1445 aa16.03■□□□□ 0.16
EDRF1-205ENST00000368815 KCNH8Q96L42 1107 aa16■□□□□ 0.15
EDRF1-205ENST00000368815 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.98■□□□□ 0.15
EDRF1-205ENST00000368815 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.97■□□□□ 0.15
EDRF1-205ENST00000368815 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.97■□□□□ 0.15
EDRF1-205ENST00000368815 PBRM1Q86U86 1689 aa15.96■□□□□ 0.15
EDRF1-205ENST00000368815 ADAMTS12P58397 1594 aa15.96■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 ARHGEF11O15085 1522 aa15.95■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 CHD1O14646 1710 aa15.95■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.92■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 CUL7Q14999 1698 aa15.91■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 NUP160Q12769 1436 aa15.91■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 GOLGA3Q08378 1498 aa15.91■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.91■□□□□ 0.14
EDRF1-205ENST00000368815 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
EDRF1-205ENST00000368815 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.88■□□□□ 0.13
EDRF1-205ENST00000368815 PRXQ9BXM0 1461 aa15.81■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 IQGAP2Q13576 1575 aa15.81■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 CEP170Q5SW79 1584 aa15.81■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.8■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.8■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.8■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 CEP162Q5TB80 1403 aa15.79■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 CLIP1P30622 1438 aa15.78■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 ARAP1Q96P48 1450 aa15.78■□□□□ 0.12
EDRF1-205ENST00000368815 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.75■□□□□ 0.11
EDRF1-205ENST00000368815 MYT1Q01538 1121 aa15.75■□□□□ 0.11
EDRF1-205ENST00000368815 UACAQ9BZF9 1416 aa15.74■□□□□ 0.11
EDRF1-205ENST00000368815 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.73■□□□□ 0.11
EDRF1-205ENST00000368815 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
EDRF1-205ENST00000368815 FMN1Q68DA7 1419 aa15.68■□□□□ 0.1
EDRF1-205ENST00000368815 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
EDRF1-205ENST00000368815 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.65■□□□□ 0.1
EDRF1-205ENST00000368815 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.63■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.62■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.6■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 KIF21BO75037 1637 aa15.6■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 NEUROD1Q13562 356 aa15.59■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 TRIM52Q96A61 297 aa15.59■□□□□ 0.09
EDRF1-205ENST00000368815 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.57■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 ASXL2Q76L83 1435 aa15.56■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 DISP1Q96F81 1524 aa15.56■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.55■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 ABCC2Q92887 1545 aa15.54■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 KIAA0556O60303 1618 aa15.54■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.52■□□□□ 0.08
EDRF1-205ENST00000368815 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.51■□□□□ 0.07
EDRF1-205ENST00000368815 CD109Q6YHK3 1445 aa15.49■□□□□ 0.07
EDRF1-205ENST00000368815 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.48■□□□□ 0.07
EDRF1-205ENST00000368815 SHROOM2Q13796 1616 aa15.47■□□□□ 0.07
EDRF1-205ENST00000368815 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
EDRF1-205ENST00000368815 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.45■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.45■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 MLECQ14165 292 aa15.44■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.44■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 TSPY4P0CV99 314 aa15.44■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 TSPY10P0CW01 314 aa15.44■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.44■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 ATP10BO94823 1461 aa15.42■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.42■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.4■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.4■□□□□ 0.06
EDRF1-205ENST00000368815 RAPGEF3O95398 923 aa15.39■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.39■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.38■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.37■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.37■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.36■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.35■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 HECW1Q76N89 1606 aa15.34■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
EDRF1-205ENST00000368815 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
EDRF1-205ENST00000368815 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
EDRF1-205ENST00000368815 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.044e-7■■□□□ 14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms