RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359276.8

CTPS2-201, Transcript of CTP synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS2, Length 3,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2-201ENST00000359276 SMARCA2P51531 1590 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS2-201ENST00000359276 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CTPS2-201ENST00000359276 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.7■■□□□ 1.23
CTPS2-201ENST00000359276 KIF21BO75037 1637 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS2-201ENST00000359276 NACADO15069 1562 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS2-201ENST00000359276 TONSLQ96HA7 1378 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS2-201ENST00000359276 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS2-201ENST00000359276 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTPS2-201ENST00000359276 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTPS2-201ENST00000359276 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS2-201ENST00000359276 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CTPS2-201ENST00000359276 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS2-201ENST00000359276 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS2-201ENST00000359276 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTPS2-201ENST00000359276 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTPS2-201ENST00000359276 MRS2Q9HD23 443 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS2-201ENST00000359276 WDR97A6NE52 1622 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS2-201ENST00000359276 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTPS2-201ENST00000359276 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CTPS2-201ENST00000359276 SYNJ1O43426 1573 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS2-201ENST00000359276 SMARCA4P51532 1647 aa22.49■■□□□ 1.19
CTPS2-201ENST00000359276 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CTPS2-201ENST00000359276 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CTPS2-201ENST00000359276 ARAP1Q96P48 1450 aa22.45■■□□□ 1.18
CTPS2-201ENST00000359276 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CTPS2-201ENST00000359276 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC184Q52MB2 194 aa22.42■■□□□ 1.18
CTPS2-201ENST00000359276 IL27Q8NEV9 243 aa22.41■■□□□ 1.18
CTPS2-201ENST00000359276 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.39■■□□□ 1.18
CTPS2-201ENST00000359276 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTPS2-201ENST00000359276 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS2-201ENST00000359276 MAPKBP1O60336 1514 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS2-201ENST00000359276 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
CTPS2-201ENST00000359276 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS2-201ENST00000359276 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTPS2-201ENST00000359276 NEFMP07197 916 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS2-201ENST00000359276 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTPS2-201ENST00000359276 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS2-201ENST00000359276 KIF27Q86VH2 1401 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS2-201ENST00000359276 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS2-201ENST00000359276 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTPS2-201ENST00000359276 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTPS2-201ENST00000359276 CUX2O14529 1486 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS2-201ENST00000359276 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS2-201ENST00000359276 FOXD1Q16676 465 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS2-201ENST00000359276 PRXQ9BXM0 1461 aa22.14■■□□□ 1.14
CTPS2-201ENST00000359276 ARID3CA6NKF2 412 aa22.13■■□□□ 1.13
CTPS2-201ENST00000359276 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS2-201ENST00000359276 AKNAQ7Z591 1439 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS2-201ENST00000359276 TMC1Q8TDI8 760 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS2-201ENST00000359276 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS2-201ENST00000359276 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTPS2-201ENST00000359276 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.04■■□□□ 1.12
CTPS2-201ENST00000359276 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.04■■□□□ 1.12
CTPS2-201ENST00000359276 NUDCQ9Y266 331 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS2-201ENST00000359276 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS2-201ENST00000359276 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS2-201ENST00000359276 SLC4A3P48751 1232 aa22■■□□□ 1.11
CTPS2-201ENST00000359276 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.97■■□□□ 1.11
CTPS2-201ENST00000359276 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTPS2-201ENST00000359276 PDE4AP27815 886 aa21.96■■□□□ 1.11
CTPS2-201ENST00000359276 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.96■■□□□ 1.11
CTPS2-201ENST00000359276 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.95■■□□□ 1.11
CTPS2-201ENST00000359276 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.94■■□□□ 1.1
CTPS2-201ENST00000359276 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.94■■□□□ 1.1
CTPS2-201ENST00000359276 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS2-201ENST00000359276 ARXQ96QS3 562 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS2-201ENST00000359276 TIAM1Q13009 1591 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS2-201ENST00000359276 TOP2BQ02880 1626 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC7Q96M83 1385 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS2-201ENST00000359276 SKAP1Q86WV1 359 aa21.89■■□□□ 1.1
CTPS2-201ENST00000359276 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 IGF1RP08069 1367 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 UACAQ9BZF9 1416 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 GSE1Q14687 1217 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 PLIN1O60240 522 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 USP35Q9P2H5 1018 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS2-201ENST00000359276 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.81■■□□□ 1.08
CTPS2-201ENST00000359276 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.81■■□□□ 1.08
CTPS2-201ENST00000359276 FMN1Q68DA7 1419 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS2-201ENST00000359276 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS2-201ENST00000359276 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS2-201ENST00000359276 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS2-201ENST00000359276 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CTPS2-201ENST00000359276 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTPS2-201ENST00000359276 NFKBIBQ15653 356 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS2-201ENST00000359276 CUX1P39880 1505 aa21.75■■□□□ 1.07
CTPS2-201ENST00000359276 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTPS2-201ENST00000359276 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
CTPS2-201ENST00000359276 BACH2Q9BYV9 841 aa21.74■■□□□ 1.07
CTPS2-201ENST00000359276 PTPRKQ15262 1439 aa21.73■■□□□ 1.07
CTPS2-201ENST00000359276 RGS3P49796 1198 aa21.73■■□□□ 1.07
CTPS2-201ENST00000359276 HFM1A2PYH4 1435 aa21.69■■□□□ 1.06
CTPS2-201ENST00000359276 NAIPQ13075 1403 aa21.69■■□□□ 1.06
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