RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343537.11

TP53BP2-201, Transcript of tumor protein p53 binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TP53BP2, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP2-201ENST00000343537 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.69■■□□□ 1.7
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TP53BP2-201ENST00000343537 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.62■■□□□ 1.69
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TP53BP2-201ENST00000343537 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.58■■□□□ 1.69
TP53BP2-201ENST00000343537 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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TP53BP2-201ENST00000343537 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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TP53BP2-201ENST00000343537 C14orf37Q86TY3 774 aa25.16■■□□□ 1.62
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TP53BP2-201ENST00000343537 DCAF11Q8TEB1 546 aa25■■□□□ 1.59
TP53BP2-201ENST00000343537 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25■■□□□ 1.59
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TP53BP2-201ENST00000343537 TOPBP1Q92547 1522 aa24.86■■□□□ 1.57
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TP53BP2-201ENST00000343537 TMF1P82094 1093 aa24.72■■□□□ 1.55
TP53BP2-201ENST00000343537 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
TP53BP2-201ENST00000343537 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.7■■□□□ 1.54
TP53BP2-201ENST00000343537 STK26Q9P289 416 aa24.69■■□□□ 1.54
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TP53BP2-201ENST00000343537 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TP53BP2-201ENST00000343537 TOP2BQ02880 1626 aa24.66■■□□□ 1.54
TP53BP2-201ENST00000343537 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
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