RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342228.7

SLC20A2-201, Transcript of solute carrier family 20 member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A2, Length 3,657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A2-201ENST00000342228 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.79■□□□□ 0.6
SLC20A2-201ENST00000342228 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SLC20A2-201ENST00000342228 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.76■□□□□ 0.59
SLC20A2-201ENST00000342228 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.74■□□□□ 0.59
SLC20A2-201ENST00000342228 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.73■□□□□ 0.59
SLC20A2-201ENST00000342228 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.73■□□□□ 0.59
SLC20A2-201ENST00000342228 P3H3Q8IVL6 736 aa18.71■□□□□ 0.59
SLC20A2-201ENST00000342228 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.71■□□□□ 0.59
SLC20A2-201ENST00000342228 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.69■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.68■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.68■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 WDR97A6NE52 1622 aa18.68■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.65■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.65■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 TOPBP1Q92547 1522 aa18.65■□□□□ 0.58
SLC20A2-201ENST00000342228 KCNH8Q96L42 1107 aa18.63■□□□□ 0.57
SLC20A2-201ENST00000342228 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.63■□□□□ 0.57
SLC20A2-201ENST00000342228 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.63■□□□□ 0.57
SLC20A2-201ENST00000342228 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.62■□□□□ 0.57
SLC20A2-201ENST00000342228 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SLC20A2-201ENST00000342228 CUL7Q14999 1698 aa18.61■□□□□ 0.57
SLC20A2-201ENST00000342228 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.577e-6■■□□□ 13.1
SLC20A2-201ENST00000342228 NESP48681 1621 aa18.6■□□□□ 0.57
SLC20A2-201ENST00000342228 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.58■□□□□ 0.56
SLC20A2-201ENST00000342228 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.55■□□□□ 0.56
SLC20A2-201ENST00000342228 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A2-201ENST00000342228 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SLC20A2-201ENST00000342228 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A2-201ENST00000342228 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.52■□□□□ 0.55
SLC20A2-201ENST00000342228 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SLC20A2-201ENST00000342228 FMN1Q68DA7 1419 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A2-201ENST00000342228 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SLC20A2-201ENST00000342228 SAMD9Q5K651 1589 aa18.49■□□□□ 0.55
SLC20A2-201ENST00000342228 PTPRKQ15262 1439 aa18.49■□□□□ 0.55
SLC20A2-201ENST00000342228 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A2-201ENST00000342228 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SLC20A2-201ENST00000342228 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.45■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.44■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 HFM1A2PYH4 1435 aa18.43■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 GRIN2BQ13224 1484 aa18.43■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.42■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.42■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.42■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 NCOA2Q15596 1464 aa18.4■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 UACAQ9BZF9 1416 aa18.4■□□□□ 0.54
SLC20A2-201ENST00000342228 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.39■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 NAIPQ13075 1403 aa18.38■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.38■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 TONSLQ96HA7 1378 aa18.36■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.35■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.35■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.34■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 ARHGEF11O15085 1522 aa18.34■□□□□ 0.53
SLC20A2-201ENST00000342228 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.33■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 CCER2I3L3R5 266 aa18.33■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.3■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.3■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 ANP32CO43423 234 aa18.29■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 FKBP8Q14318 412 aa18.28■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 BCANQ96GW7 911 aa18.27■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 BCL11AQ9H165 835 aa18.27■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SLC20A2-201ENST00000342228 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.26■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 TRIM52Q96A61 297 aa18.26■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.26■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.25■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 KDM6BO15054 1643 aa18.24■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 PBRM1Q86U86 1689 aa18.22■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.22■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 HECW1Q76N89 1606 aa18.22■□□□□ 0.51
SLC20A2-201ENST00000342228 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.2■□□□□ 0.5
SLC20A2-201ENST00000342228 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SLC20A2-201ENST00000342228 IQGAP2Q13576 1575 aa18.18■□□□□ 0.5
SLC20A2-201ENST00000342228 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SLC20A2-201ENST00000342228 AKNAQ7Z591 1439 aa18.16■□□□□ 0.5
SLC20A2-201ENST00000342228 ADAMTS12P58397 1594 aa18.15■□□□□ 0.5
SLC20A2-201ENST00000342228 WDR62O43379 1518 aa18.14■□□□□ 0.5
SLC20A2-201ENST00000342228 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.14■□□□□ 0.49
SLC20A2-201ENST00000342228 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SLC20A2-201ENST00000342228 MIA2Q96PC5 1412 aa18.12■□□□□ 0.49
SLC20A2-201ENST00000342228 NEFLP07196 543 aa18.1■□□□□ 0.49
SLC20A2-201ENST00000342228 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.09■□□□□ 0.49
SLC20A2-201ENST00000342228 ARID3CA6NKF2 412 aa18.08■□□□□ 0.48
SLC20A2-201ENST00000342228 FOXD1Q16676 465 aa18.07■□□□□ 0.48
SLC20A2-201ENST00000342228 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.05■□□□□ 0.48
SLC20A2-201ENST00000342228 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
SLC20A2-201ENST00000342228 DAPK1P53355 1430 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC20A2-201ENST00000342228 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SLC20A2-201ENST00000342228 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
SLC20A2-201ENST00000342228 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.02■□□□□ 0.48
SLC20A2-201ENST00000342228 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC20A2-201ENST00000342228 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86 ms