RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.14■■■□□ 2.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.12■■■□□ 2.57
PTDSS1-201ENST00000337004 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.09■■■□□ 2.57
PTDSS1-201ENST00000337004 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.09■■■□□ 2.57
PTDSS1-201ENST00000337004 P3H3Q8IVL6 736 aa31.08■■■□□ 2.57
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
PTDSS1-201ENST00000337004 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.05■■■□□ 2.56
PTDSS1-201ENST00000337004 MAPKBP1O60336 1514 aa31.05■■■□□ 2.56
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
PTDSS1-201ENST00000337004 TOPBP1Q92547 1522 aa31.02■■■□□ 2.56
PTDSS1-201ENST00000337004 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
PTDSS1-201ENST00000337004 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PTDSS1-201ENST00000337004 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.02■■■□□ 2.56
PTDSS1-201ENST00000337004 EFCAB5A4FU69 1503 aa31■■■□□ 2.55
PTDSS1-201ENST00000337004 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.99■■■□□ 2.55
PTDSS1-201ENST00000337004 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.98■■■□□ 2.55
PTDSS1-201ENST00000337004 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.96■■■□□ 2.55
PTDSS1-201ENST00000337004 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.558e-8■■■■■ 39.5
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PTDSS1-201ENST00000337004 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.92■■■□□ 2.54
PTDSS1-201ENST00000337004 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.89■■■□□ 2.54
PTDSS1-201ENST00000337004 NESP48681 1621 aa30.87■■■□□ 2.53
PTDSS1-201ENST00000337004 FMN1Q68DA7 1419 aa30.87■■■□□ 2.53
PTDSS1-201ENST00000337004 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.83■■■□□ 2.53
PTDSS1-201ENST00000337004 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.78■■■□□ 2.52
PTDSS1-201ENST00000337004 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.74■■■□□ 2.51
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR97A6NE52 1622 aa30.73■■■□□ 2.51
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PTDSS1-201ENST00000337004 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.73■■■□□ 2.51
PTDSS1-201ENST00000337004 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.71■■■□□ 2.51
PTDSS1-201ENST00000337004 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.71■■■□□ 2.51
PTDSS1-201ENST00000337004 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
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PTDSS1-201ENST00000337004 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.65■■■□□ 2.5
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PTDSS1-201ENST00000337004 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.62■■■□□ 2.49
PTDSS1-201ENST00000337004 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.62■■■□□ 2.49
PTDSS1-201ENST00000337004 SAMD9Q5K651 1589 aa30.61■■■□□ 2.49
PTDSS1-201ENST00000337004 HFM1A2PYH4 1435 aa30.58■■■□□ 2.49
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNH8Q96L42 1107 aa30.56■■■□□ 2.48
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.56■■■□□ 2.48
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PTDSS1-201ENST00000337004 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.53■■■□□ 2.48
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PTDSS1-201ENST00000337004 NCOA2Q15596 1464 aa30.53■■■□□ 2.48
PTDSS1-201ENST00000337004 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PTDSS1-201ENST00000337004 TONSLQ96HA7 1378 aa30.53■■■□□ 2.48
PTDSS1-201ENST00000337004 MYT1Q01538 1121 aa30.52■■■□□ 2.48
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPRKQ15262 1439 aa30.52■■■□□ 2.48
PTDSS1-201ENST00000337004 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.46■■■□□ 2.47
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.45■■■□□ 2.47
PTDSS1-201ENST00000337004 NAIPQ13075 1403 aa30.44■■■□□ 2.46
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PTDSS1-201ENST00000337004 ANP32CO43423 234 aa30.4■■■□□ 2.46
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.39■■■□□ 2.46
PTDSS1-201ENST00000337004 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.36■■■□□ 2.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGEF11O15085 1522 aa30.35■■■□□ 2.45
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.33■■■□□ 2.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.28■■■□□ 2.44
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.27■■■□□ 2.44
PTDSS1-201ENST00000337004 HECW1Q76N89 1606 aa30.26■■■□□ 2.43
PTDSS1-201ENST00000337004 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.24■■■□□ 2.43
PTDSS1-201ENST00000337004 IQGAP2Q13576 1575 aa30.21■■■□□ 2.43
PTDSS1-201ENST00000337004 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.21■■■□□ 2.43
PTDSS1-201ENST00000337004 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
PTDSS1-201ENST00000337004 AKNAQ7Z591 1439 aa30.2■■■□□ 2.43
PTDSS1-201ENST00000337004 MIA2Q96PC5 1412 aa30.19■■■□□ 2.42
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM52Q96A61 297 aa30.17■■■□□ 2.42
PTDSS1-201ENST00000337004 PBRM1Q86U86 1689 aa30.15■■■□□ 2.42
PTDSS1-201ENST00000337004 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.14■■■□□ 2.42
PTDSS1-201ENST00000337004 FKBP8Q14318 412 aa30.14■■■□□ 2.42
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PTDSS1-201ENST00000337004 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.12■■■□□ 2.41
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PTDSS1-201ENST00000337004 WDR62O43379 1518 aa30.07■■■□□ 2.4
PTDSS1-201ENST00000337004 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.07■■■□□ 2.4
PTDSS1-201ENST00000337004 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PTDSS1-201ENST00000337004 BCANQ96GW7 911 aa30.05■■■□□ 2.4
PTDSS1-201ENST00000337004 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PTDSS1-201ENST00000337004 ARID3CA6NKF2 412 aa30.01■■■□□ 2.4
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
PTDSS1-201ENST00000337004 ROCK1Q13464 1354 aa29.98■■■□□ 2.39
PTDSS1-201ENST00000337004 KDM6BO15054 1643 aa29.97■■■□□ 2.39
PTDSS1-201ENST00000337004 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.97■■■□□ 2.39
PTDSS1-201ENST00000337004 IFT140Q96RY7 1462 aa29.96■■■□□ 2.39
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.95■■■□□ 2.39
PTDSS1-201ENST00000337004 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.93■■■□□ 2.38
PTDSS1-201ENST00000337004 DAPK1P53355 1430 aa29.93■■■□□ 2.38
PTDSS1-201ENST00000337004 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
PTDSS1-201ENST00000337004 DISP1Q96F81 1524 aa29.88■■■□□ 2.37
PTDSS1-201ENST00000337004 ABCC5O15440 1437 aa29.88■■■□□ 2.37
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