RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.95■■■□□ 2.87
HOXD1-201ENST00000331462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.89■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 MAPKBP1O60336 1514 aa32.89■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 CUL7Q14999 1698 aa32.87■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 TOPBP1Q92547 1522 aa32.85■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.83■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXD1-201ENST00000331462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.76■■■□□ 2.84
HOXD1-201ENST00000331462 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.73■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 ITGAEP38570 1179 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 WDR97A6NE52 1622 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXD1-201ENST00000331462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD1-201ENST00000331462 NESP48681 1621 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD1-201ENST00000331462 FMN1Q68DA7 1419 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXD1-201ENST00000331462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 SAMD9Q5K651 1589 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 P3H3Q8IVL6 736 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
HOXD1-201ENST00000331462 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXD1-201ENST00000331462 GRIN2BQ13224 1484 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.36■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 HFM1A2PYH4 1435 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 NCOA2Q15596 1464 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 UACAQ9BZF9 1416 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF11O15085 1522 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRKQ15262 1439 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD1-201ENST00000331462 NAIPQ13075 1403 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXD1-201ENST00000331462 MYT1Q01538 1121 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 HECW1Q76N89 1606 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 TONSLQ96HA7 1378 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 PBRM1Q86U86 1689 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 KCNH8Q96L42 1107 aa32.07■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 AKNAQ7Z591 1439 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 ADAMTS12P58397 1594 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 IQGAP2Q13576 1575 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 CCER2I3L3R5 266 aa32.01■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.01■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
HOXD1-201ENST00000331462 MIA2Q96PC5 1412 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD1-201ENST00000331462 WDR62O43379 1518 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD1-201ENST00000331462 ANP32CO43423 234 aa31.87■■■□□ 2.69
HOXD1-201ENST00000331462 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
HOXD1-201ENST00000331462 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.85■■■□□ 2.69
HOXD1-201ENST00000331462 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
HOXD1-201ENST00000331462 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
HOXD1-201ENST00000331462 KDM6BO15054 1643 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXD1-201ENST00000331462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXD1-201ENST00000331462 IFT140Q96RY7 1462 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXD1-201ENST00000331462 ROCK1Q13464 1354 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0556O60303 1618 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 ERCC6Q03468 1493 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 DISP1Q96F81 1524 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 DAPK1P53355 1430 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 FKBP8Q14318 412 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM52Q96A61 297 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC5O15440 1437 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
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