RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GLIS1-201ENST00000312233 PRDM2Q13029 1718 aa24.22■■□□□ 1.47
GLIS1-201ENST00000312233 NESP48681 1621 aa24.22■■□□□ 1.47
GLIS1-201ENST00000312233 PLEKHG5O94827 1062 aa24.2■■□□□ 1.46
GLIS1-201ENST00000312233 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GLIS1-201ENST00000312233 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.17■■□□□ 1.46
GLIS1-201ENST00000312233 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GLIS1-201ENST00000312233 CCER2I3L3R5 266 aa24.15■■□□□ 1.46
GLIS1-201ENST00000312233 SYNJ1O43426 1573 aa24.13■■□□□ 1.45
GLIS1-201ENST00000312233 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.12■■□□□ 1.45
GLIS1-201ENST00000312233 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.12■■□□□ 1.45
GLIS1-201ENST00000312233 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GLIS1-201ENST00000312233 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.08■■□□□ 1.45
GLIS1-201ENST00000312233 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.07■■□□□ 1.44
GLIS1-201ENST00000312233 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.06■■□□□ 1.44
GLIS1-201ENST00000312233 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GLIS1-201ENST00000312233 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GLIS1-201ENST00000312233 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GLIS1-201ENST00000312233 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GLIS1-201ENST00000312233 CUX1P39880 1505 aa24.01■■□□□ 1.43
GLIS1-201ENST00000312233 TOP2BQ02880 1626 aa24■■□□□ 1.43
GLIS1-201ENST00000312233 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GLIS1-201ENST00000312233 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24■■□□□ 1.43
GLIS1-201ENST00000312233 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.98■■□□□ 1.43
GLIS1-201ENST00000312233 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.98■■□□□ 1.43
GLIS1-201ENST00000312233 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.97■■□□□ 1.43
GLIS1-201ENST00000312233 ANP32CO43423 234 aa23.96■■□□□ 1.43
GLIS1-201ENST00000312233 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.95■■□□□ 1.42
GLIS1-201ENST00000312233 ZMYND15Q9H091 742 aa23.93■■□□□ 1.42
GLIS1-201ENST00000312233 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.93■■□□□ 1.42
GLIS1-201ENST00000312233 USP35Q9P2H5 1018 aa23.92■■□□□ 1.42
GLIS1-201ENST00000312233 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.91■■□□□ 1.42
GLIS1-201ENST00000312233 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.91■■□□□ 1.42
GLIS1-201ENST00000312233 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.9■■□□□ 1.42
GLIS1-201ENST00000312233 SOGA1O94964 1423 aa23.89■■□□□ 1.42
GLIS1-201ENST00000312233 NEFMP07197 916 aa23.88■■□□□ 1.41
GLIS1-201ENST00000312233 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
GLIS1-201ENST00000312233 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.83■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 EEA1Q15075 1411 aa23.83■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 GOLGA3Q08378 1498 aa23.83■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.81■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 CLIP1P30622 1438 aa23.81■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.8■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.8■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 TOPBP1Q92547 1522 aa23.79■■□□□ 1.4
GLIS1-201ENST00000312233 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
GLIS1-201ENST00000312233 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.76■■□□□ 1.39
GLIS1-201ENST00000312233 WDR97A6NE52 1622 aa23.73■■□□□ 1.39
GLIS1-201ENST00000312233 GSE1Q14687 1217 aa23.72■■□□□ 1.39
GLIS1-201ENST00000312233 CUX2O14529 1486 aa23.68■■□□□ 1.38
GLIS1-201ENST00000312233 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
GLIS1-201ENST00000312233 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.68■■□□□ 1.38
GLIS1-201ENST00000312233 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
GLIS1-201ENST00000312233 ERCC6Q03468 1493 aa23.66■■□□□ 1.38
GLIS1-201ENST00000312233 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.66■■□□□ 1.38
GLIS1-201ENST00000312233 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
GLIS1-201ENST00000312233 MAPKBP1O60336 1514 aa23.65■■□□□ 1.38
GLIS1-201ENST00000312233 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.61■■□□□ 1.37
GLIS1-201ENST00000312233 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
GLIS1-201ENST00000312233 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.56■■□□□ 1.36
GLIS1-201ENST00000312233 KIF27Q86VH2 1401 aa23.56■■□□□ 1.36
GLIS1-201ENST00000312233 WDR62O43379 1518 aa23.55■■□□□ 1.36
GLIS1-201ENST00000312233 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GLIS1-201ENST00000312233 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GLIS1-201ENST00000312233 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.52■■□□□ 1.36
GLIS1-201ENST00000312233 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
GLIS1-201ENST00000312233 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
GLIS1-201ENST00000312233 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.45■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.44■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 KIF21BO75037 1637 aa23.44■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 NFKBIBQ15653 356 aa23.43■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 IGF1RP08069 1367 aa23.39■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.39■■□□□ 1.34
GLIS1-201ENST00000312233 PRXQ9BXM0 1461 aa23.39■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.39■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.36■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.34■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC184Q52MB2 194 aa23.33■■□□□ 1.33
GLIS1-201ENST00000312233 IFT140Q96RY7 1462 aa23.33■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 PDE4AP27815 886 aa23.32■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.31■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.3■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 AKNAQ7Z591 1439 aa23.3■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 AAMPQ13685 434 aa23.29■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.29■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 BACH2Q9BYV9 841 aa23.28■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GLIS1-201ENST00000312233 FGD1P98174 961 aa23.26■■□□□ 1.31
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