RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 PRDM2Q13029 1718 aa26.83■■□□□ 1.89
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CNOT11-201ENST00000289382 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CNOT11-201ENST00000289382 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.79■■□□□ 1.88
CNOT11-201ENST00000289382 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.76■■□□□ 1.87
CNOT11-201ENST00000289382 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CNOT11-201ENST00000289382 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.72■■□□□ 1.87
CNOT11-201ENST00000289382 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.72■■□□□ 1.87
CNOT11-201ENST00000289382 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.71■■□□□ 1.87
CNOT11-201ENST00000289382 NESP48681 1621 aa26.71■■□□□ 1.87
CNOT11-201ENST00000289382 TIAM1Q13009 1591 aa26.71■■□□□ 1.87
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CNOT11-201ENST00000289382 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.65■■□□□ 1.86
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CNOT11-201ENST00000289382 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.63■■□□□ 1.85
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CNOT11-201ENST00000289382 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CNOT11-201ENST00000289382 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.59■■□□□ 1.85
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CNOT11-201ENST00000289382 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
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CNOT11-201ENST00000289382 TOPBP1Q92547 1522 aa26.54■■□□□ 1.84
CNOT11-201ENST00000289382 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.52■■□□□ 1.84
CNOT11-201ENST00000289382 MAP3K1Q13233 1512 aa26.52■■□□□ 1.84
CNOT11-201ENST00000289382 WDR97A6NE52 1622 aa26.51■■□□□ 1.83
CNOT11-201ENST00000289382 MSH5O43196 834 aa26.5■■□□□ 1.83
CNOT11-201ENST00000289382 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.5■■□□□ 1.83
CNOT11-201ENST00000289382 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.49■■□□□ 1.83
CNOT11-201ENST00000289382 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.48■■□□□ 1.83
CNOT11-201ENST00000289382 TRIM52Q96A61 297 aa26.45■■□□□ 1.82
CNOT11-201ENST00000289382 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CNOT11-201ENST00000289382 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CNOT11-201ENST00000289382 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CNOT11-201ENST00000289382 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.42■■□□□ 1.82
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CNOT11-201ENST00000289382 CCER2I3L3R5 266 aa26.38■■□□□ 1.81
CNOT11-201ENST00000289382 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.34■■□□□ 1.81
CNOT11-201ENST00000289382 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.33■■□□□ 1.81
CNOT11-201ENST00000289382 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.32■■□□□ 1.8
CNOT11-201ENST00000289382 ANP32CO43423 234 aa26.31■■□□□ 1.8
CNOT11-201ENST00000289382 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.27■■□□□ 1.8
CNOT11-201ENST00000289382 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.26■■□□□ 1.79
CNOT11-201ENST00000289382 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.26■■□□□ 1.79
CNOT11-201ENST00000289382 CUL7Q14999 1698 aa26.26■■□□□ 1.79
CNOT11-201ENST00000289382 PTPRKQ15262 1439 aa26.25■■□□□ 1.79
CNOT11-201ENST00000289382 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.25■■□□□ 1.79
CNOT11-201ENST00000289382 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.22■■□□□ 1.79
CNOT11-201ENST00000289382 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.22■■□□□ 1.79
CNOT11-201ENST00000289382 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.22■■□□□ 1.79
CNOT11-201ENST00000289382 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
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CNOT11-201ENST00000289382 FMN1Q68DA7 1419 aa26.19■■□□□ 1.78
CNOT11-201ENST00000289382 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.19■■□□□ 1.78
CNOT11-201ENST00000289382 ARID3CA6NKF2 412 aa26.15■■□□□ 1.78
CNOT11-201ENST00000289382 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.15■■□□□ 1.78
CNOT11-201ENST00000289382 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.14■■□□□ 1.77
CNOT11-201ENST00000289382 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
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CNOT11-201ENST00000289382 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.1■■□□□ 1.77
CNOT11-201ENST00000289382 SAMD9Q5K651 1589 aa26.09■■□□□ 1.77
CNOT11-201ENST00000289382 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
CNOT11-201ENST00000289382 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.08■■□□□ 1.77
CNOT11-201ENST00000289382 GRIN2BQ13224 1484 aa26.07■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.07■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.06■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 TONSLQ96HA7 1378 aa26.06■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.05■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.05■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.04■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 HFM1A2PYH4 1435 aa26.02■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 NAIPQ13075 1403 aa26.02■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.02■■□□□ 1.76
CNOT11-201ENST00000289382 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.01■■□□□ 1.75
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CNOT11-201ENST00000289382 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CNOT11-201ENST00000289382 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.93■■□□□ 1.74
CNOT11-201ENST00000289382 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.92■■□□□ 1.74
CNOT11-201ENST00000289382 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CNOT11-201ENST00000289382 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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CNOT11-201ENST00000289382 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.89■■□□□ 1.74
CNOT11-201ENST00000289382 FOXD1Q16676 465 aa25.89■■□□□ 1.73
CNOT11-201ENST00000289382 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.88■■□□□ 1.73
CNOT11-201ENST00000289382 KDM6BO15054 1643 aa25.86■■□□□ 1.73
CNOT11-201ENST00000289382 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGEF11O15085 1522 aa25.84■■□□□ 1.73
CNOT11-201ENST00000289382 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.84■■□□□ 1.73
CNOT11-201ENST00000289382 PBRM1Q86U86 1689 aa25.81■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.8■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.78■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 IQGAP2Q13576 1575 aa25.78■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
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