RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 PODXL2Q9NZ53 605 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRO-201ENST00000281171 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.64
PTPRO-201ENST00000281171 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
PTPRO-201ENST00000281171 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRO-201ENST00000281171 TONSLQ96HA7 1378 aa19■□□□□ 0.63
PTPRO-201ENST00000281171 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRO-201ENST00000281171 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRO-201ENST00000281171 P3H3Q8IVL6 736 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRO-201ENST00000281171 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRO-201ENST00000281171 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRO-201ENST00000281171 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
PTPRO-201ENST00000281171 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRO-201ENST00000281171 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRO-201ENST00000281171 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRO-201ENST00000281171 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
PTPRO-201ENST00000281171 TSPY4P0CV99 314 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRO-201ENST00000281171 TSPY10P0CW01 314 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRO-201ENST00000281171 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGA3Q08378 1498 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRO-201ENST00000281171 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRO-201ENST00000281171 CLIP1P30622 1438 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRO-201ENST00000281171 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
PTPRO-201ENST00000281171 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
PTPRO-201ENST00000281171 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRO-201ENST00000281171 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRO-201ENST00000281171 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRO-201ENST00000281171 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRO-201ENST00000281171 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRO-201ENST00000281171 KIF27Q86VH2 1401 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRO-201ENST00000281171 MRS2Q9HD23 443 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRO-201ENST00000281171 USP35Q9P2H5 1018 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRO-201ENST00000281171 ARID3CA6NKF2 412 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRO-201ENST00000281171 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
PTPRO-201ENST00000281171 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRO-201ENST00000281171 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRO-201ENST00000281171 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRO-201ENST00000281171 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRO-201ENST00000281171 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRO-201ENST00000281171 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRO-201ENST00000281171 TMC1Q8TDI8 760 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRO-201ENST00000281171 PTMSP20962 102 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRO-201ENST00000281171 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRO-201ENST00000281171 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRO-201ENST00000281171 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRO-201ENST00000281171 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRO-201ENST00000281171 CEP162Q5TB80 1403 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRO-201ENST00000281171 CDCA8Q53HL2 280 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRO-201ENST00000281171 ARID3AQ99856 593 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRO-201ENST00000281171 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
PTPRO-201ENST00000281171 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
PTPRO-201ENST00000281171 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRO-201ENST00000281171 GSE1Q14687 1217 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRO-201ENST00000281171 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRO-201ENST00000281171 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
PTPRO-201ENST00000281171 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRO-201ENST00000281171 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRO-201ENST00000281171 CCER2I3L3R5 266 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRO-201ENST00000281171 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRO-201ENST00000281171 SMARCA2P51531 1590 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRO-201ENST00000281171 APPP05067 770 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRO-201ENST00000281171 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 PLCB2Q00722 1185 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 CFAP53Q96M91 514 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 ERCC6Q03468 1493 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 MAP7D2Q96T17 732 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 NRDCO43847 1150 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 RGS3P49796 1198 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 HSCBQ8IWL3 235 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 GBP4Q96PP9 640 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 PDE4CQ08493 712 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 IL27Q8NEV9 243 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRO-201ENST00000281171 CALRP27797 417 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRO-201ENST00000281171 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRO-201ENST00000281171 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRO-201ENST00000281171 KANK1Q14678 1352 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRO-201ENST00000281171 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRO-201ENST00000281171 KCNH8Q96L42 1107 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRO-201ENST00000281171 TPM2P07951 284 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRO-201ENST00000281171 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.24■□□□□ 0.51
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