RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278845.8

EML3-201, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene EML3, Length 3,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EML3-201ENST00000278845 MIER1Q8N108 512 aa25.35■■□□□ 1.65
EML3-201ENST00000278845 TOPBP1Q92547 1522 aa25.35■■□□□ 1.65
EML3-201ENST00000278845 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
EML3-201ENST00000278845 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.32■■□□□ 1.64
EML3-201ENST00000278845 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
EML3-201ENST00000278845 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.28■■□□□ 1.64
EML3-201ENST00000278845 BCL11AQ9H165 835 aa25.26■■□□□ 1.63
EML3-201ENST00000278845 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.22■■□□□ 1.63
EML3-201ENST00000278845 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.21■■□□□ 1.63
EML3-201ENST00000278845 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
EML3-201ENST00000278845 TIAM1Q13009 1591 aa25.2■■□□□ 1.62
EML3-201ENST00000278845 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.17■■□□□ 1.62
EML3-201ENST00000278845 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.17■■□□□ 1.62
EML3-201ENST00000278845 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
EML3-201ENST00000278845 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.14■■□□□ 1.61
EML3-201ENST00000278845 ARID3CA6NKF2 412 aa25.08■■□□□ 1.61
EML3-201ENST00000278845 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.08■■□□□ 1.6
EML3-201ENST00000278845 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.07■■□□□ 1.6
EML3-201ENST00000278845 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.06■■□□□ 1.6
EML3-201ENST00000278845 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.05■■□□□ 1.6
EML3-201ENST00000278845 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.03■■□□□ 1.6
EML3-201ENST00000278845 SETD5Q9C0A6 1442 aa25■■□□□ 1.59
EML3-201ENST00000278845 MAP3K1Q13233 1512 aa24.96■■□□□ 1.59
EML3-201ENST00000278845 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.96■■□□□ 1.59
EML3-201ENST00000278845 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.96■■□□□ 1.59
EML3-201ENST00000278845 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.96■■□□□ 1.59
EML3-201ENST00000278845 CUL7Q14999 1698 aa24.95■■□□□ 1.58
EML3-201ENST00000278845 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.95■■□□□ 1.58
EML3-201ENST00000278845 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.581e-6■■■■□ 22.8
EML3-201ENST00000278845 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.92■■□□□ 1.58
EML3-201ENST00000278845 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
EML3-201ENST00000278845 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.91■■□□□ 1.58
EML3-201ENST00000278845 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
EML3-201ENST00000278845 FMN1Q68DA7 1419 aa24.89■■□□□ 1.58
EML3-201ENST00000278845 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.89■■□□□ 1.57
EML3-201ENST00000278845 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.89■■□□□ 1.57
EML3-201ENST00000278845 MAPKBP1O60336 1514 aa24.89■■□□□ 1.57
EML3-201ENST00000278845 WDR97A6NE52 1622 aa24.86■■□□□ 1.57
EML3-201ENST00000278845 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.86■■□□□ 1.57
EML3-201ENST00000278845 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.83■■□□□ 1.57
EML3-201ENST00000278845 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.82■■□□□ 1.56
EML3-201ENST00000278845 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.8■■□□□ 1.56
EML3-201ENST00000278845 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.79■■□□□ 1.56
EML3-201ENST00000278845 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.76■■□□□ 1.55
EML3-201ENST00000278845 PTPRKQ15262 1439 aa24.75■■□□□ 1.55
EML3-201ENST00000278845 KCNH8Q96L42 1107 aa24.74■■□□□ 1.55
EML3-201ENST00000278845 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
EML3-201ENST00000278845 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
EML3-201ENST00000278845 NCOA2Q15596 1464 aa24.72■■□□□ 1.55
EML3-201ENST00000278845 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
EML3-201ENST00000278845 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.7■■□□□ 1.54
EML3-201ENST00000278845 SAMD9Q5K651 1589 aa24.69■■□□□ 1.54
EML3-201ENST00000278845 FBLN2P98095 1184 aa24.69■■□□□ 1.54
EML3-201ENST00000278845 GRIN2BQ13224 1484 aa24.68■■□□□ 1.54
EML3-201ENST00000278845 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.64■■□□□ 1.54
EML3-201ENST00000278845 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.63■■□□□ 1.53
EML3-201ENST00000278845 TRIM52Q96A61 297 aa24.63■■□□□ 1.53
EML3-201ENST00000278845 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.63■■□□□ 1.53
EML3-201ENST00000278845 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.62■■□□□ 1.53
EML3-201ENST00000278845 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
EML3-201ENST00000278845 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
EML3-201ENST00000278845 PBRM1Q86U86 1689 aa24.6■■□□□ 1.53
EML3-201ENST00000278845 BCANQ96GW7 911 aa24.59■■□□□ 1.53
EML3-201ENST00000278845 TONSLQ96HA7 1378 aa24.58■■□□□ 1.52
EML3-201ENST00000278845 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
EML3-201ENST00000278845 IQGAP2Q13576 1575 aa24.56■■□□□ 1.52
EML3-201ENST00000278845 NAIPQ13075 1403 aa24.54■■□□□ 1.52
EML3-201ENST00000278845 FOXD1Q16676 465 aa24.53■■□□□ 1.52
EML3-201ENST00000278845 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
EML3-201ENST00000278845 ADAMTS12P58397 1594 aa24.53■■□□□ 1.52
EML3-201ENST00000278845 HFM1A2PYH4 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
EML3-201ENST00000278845 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.51■■□□□ 1.51
EML3-201ENST00000278845 ERCC6Q03468 1493 aa24.51■■□□□ 1.51
EML3-201ENST00000278845 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
EML3-201ENST00000278845 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
EML3-201ENST00000278845 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
EML3-201ENST00000278845 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.49■■□□□ 1.51
EML3-201ENST00000278845 UACAQ9BZF9 1416 aa24.47■■□□□ 1.51
EML3-201ENST00000278845 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.47■■□□□ 1.51
EML3-201ENST00000278845 IFT140Q96RY7 1462 aa24.45■■□□□ 1.5
EML3-201ENST00000278845 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
EML3-201ENST00000278845 HECW1Q76N89 1606 aa24.43■■□□□ 1.5
EML3-201ENST00000278845 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
EML3-201ENST00000278845 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.42■■□□□ 1.5
EML3-201ENST00000278845 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
EML3-201ENST00000278845 WDR62O43379 1518 aa24.36■■□□□ 1.49
EML3-201ENST00000278845 KDM6BO15054 1643 aa24.35■■□□□ 1.49
EML3-201ENST00000278845 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.35■■□□□ 1.49
EML3-201ENST00000278845 ARHGEF11O15085 1522 aa24.34■■□□□ 1.49
EML3-201ENST00000278845 DISP1Q96F81 1524 aa24.34■■□□□ 1.49
EML3-201ENST00000278845 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.34■■□□□ 1.49
EML3-201ENST00000278845 GRIN2AQ12879 1464 aa24.33■■□□□ 1.49
EML3-201ENST00000278845 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
EML3-201ENST00000278845 ANP32CO43423 234 aa24.31■■□□□ 1.48
EML3-201ENST00000278845 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
EML3-201ENST00000278845 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
EML3-201ENST00000278845 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
EML3-201ENST00000278845 FKBP8Q14318 412 aa24.28■■□□□ 1.48
EML3-201ENST00000278845 KIAA0556O60303 1618 aa24.28■■□□□ 1.48
EML3-201ENST00000278845 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms