RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.35■■■□□ 2.13
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.35■■■□□ 2.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.33■■■□□ 2.13
LPCAT3-201ENST00000261407 MAP3K1Q13233 1512 aa28.32■■■□□ 2.12
LPCAT3-201ENST00000261407 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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LPCAT3-201ENST00000261407 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.29■■■□□ 2.12
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LPCAT3-201ENST00000261407 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.21■■■□□ 2.11
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LPCAT3-201ENST00000261407 WDR97A6NE52 1622 aa28.18■■■□□ 2.1
LPCAT3-201ENST00000261407 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.17■■■□□ 2.1
LPCAT3-201ENST00000261407 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.14■■■□□ 2.1
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LPCAT3-201ENST00000261407 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.1■■■□□ 2.09
LPCAT3-201ENST00000261407 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.1■■■□□ 2.09
LPCAT3-201ENST00000261407 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.1■■■□□ 2.09
LPCAT3-201ENST00000261407 MAPKBP1O60336 1514 aa28.09■■■□□ 2.09
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LPCAT3-201ENST00000261407 GRIN2BQ13224 1484 aa27.85■■■□□ 2.05
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LPCAT3-201ENST00000261407 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
LPCAT3-201ENST00000261407 NCOA2Q15596 1464 aa27.79■■■□□ 2.04
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LPCAT3-201ENST00000261407 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.74■■■□□ 2.03
LPCAT3-201ENST00000261407 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.72■■■□□ 2.03
LPCAT3-201ENST00000261407 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.71■■■□□ 2.03
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LPCAT3-201ENST00000261407 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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LPCAT3-201ENST00000261407 TONSLQ96HA7 1378 aa27.49■■□□□ 1.99
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LPCAT3-201ENST00000261407 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
LPCAT3-201ENST00000261407 CEP170Q5SW79 1584 aa27.22■■□□□ 1.95
LPCAT3-201ENST00000261407 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.22■■□□□ 1.95
LPCAT3-201ENST00000261407 ABCC5O15440 1437 aa27.21■■□□□ 1.95
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