RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.32■■■■□ 3.57
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RAB40C-201ENST00000248139 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.28■■■■□ 3.56
RAB40C-201ENST00000248139 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
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RAB40C-201ENST00000248139 MAPKBP1O60336 1514 aa37.09■■■■□ 3.53
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RAB40C-201ENST00000248139 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
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RAB40C-201ENST00000248139 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.74■■■■□ 3.311e-6■■■■□ 25.9
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