RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CLDN11-201ENST00000064724 CUL7Q14999 1698 aa25.55■■□□□ 1.68
CLDN11-201ENST00000064724 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.51■■□□□ 1.67
CLDN11-201ENST00000064724 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CLDN11-201ENST00000064724 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CLDN11-201ENST00000064724 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.46■■□□□ 1.67
CLDN11-201ENST00000064724 WDR97A6NE52 1622 aa25.45■■□□□ 1.67
CLDN11-201ENST00000064724 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.67
CLDN11-201ENST00000064724 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.44■■□□□ 1.66
CLDN11-201ENST00000064724 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.44■■□□□ 1.66
CLDN11-201ENST00000064724 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.43■■□□□ 1.66
CLDN11-201ENST00000064724 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.43■■□□□ 1.66
CLDN11-201ENST00000064724 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.42■■□□□ 1.66
CLDN11-201ENST00000064724 P3H3Q8IVL6 736 aa25.41■■□□□ 1.66
CLDN11-201ENST00000064724 MIER1Q8N108 512 aa25.41■■□□□ 1.66
CLDN11-201ENST00000064724 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.39■■□□□ 1.66
CLDN11-201ENST00000064724 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.38■■□□□ 1.65
CLDN11-201ENST00000064724 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.38■■□□□ 1.65
CLDN11-201ENST00000064724 ITGAEP38570 1179 aa25.38■■□□□ 1.65
CLDN11-201ENST00000064724 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN11-201ENST00000064724 FMN1Q68DA7 1419 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN11-201ENST00000064724 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN11-201ENST00000064724 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CLDN11-201ENST00000064724 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
CLDN11-201ENST00000064724 MAPKBP1O60336 1514 aa25.28■■□□□ 1.64
CLDN11-201ENST00000064724 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.28■■□□□ 1.64
CLDN11-201ENST00000064724 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.28■■□□□ 1.64
CLDN11-201ENST00000064724 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CLDN11-201ENST00000064724 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN11-201ENST00000064724 SAMD9Q5K651 1589 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN11-201ENST00000064724 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLDN11-201ENST00000064724 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.2■■□□□ 1.63
CLDN11-201ENST00000064724 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CLDN11-201ENST00000064724 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLDN11-201ENST00000064724 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLDN11-201ENST00000064724 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.14■■□□□ 1.62
CLDN11-201ENST00000064724 GRIN2BQ13224 1484 aa25.14■■□□□ 1.61
CLDN11-201ENST00000064724 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CLDN11-201ENST00000064724 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.12■■□□□ 1.61
CLDN11-201ENST00000064724 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.08■■□□□ 1.61
CLDN11-201ENST00000064724 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.04■■□□□ 1.6
CLDN11-201ENST00000064724 NCOA2Q15596 1464 aa25.03■■□□□ 1.6
CLDN11-201ENST00000064724 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.02■■□□□ 1.6
CLDN11-201ENST00000064724 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 PBRM1Q86U86 1689 aa25■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 SIN3AQ96ST3 1273 aa25■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 HFM1A2PYH4 1435 aa24.99■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 PTPRKQ15262 1439 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 ADAMTS12P58397 1594 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 ARHGEF11O15085 1522 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CLDN11-201ENST00000064724 IQGAP2Q13576 1575 aa24.95■■□□□ 1.58
CLDN11-201ENST00000064724 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN11-201ENST00000064724 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN11-201ENST00000064724 UACAQ9BZF9 1416 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN11-201ENST00000064724 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN11-201ENST00000064724 HECW1Q76N89 1606 aa24.89■■□□□ 1.58
CLDN11-201ENST00000064724 NAIPQ13075 1403 aa24.89■■□□□ 1.57
CLDN11-201ENST00000064724 IFT140Q96RY7 1462 aa24.89■■□□□ 1.57
CLDN11-201ENST00000064724 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CLDN11-201ENST00000064724 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN11-201ENST00000064724 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CLDN11-201ENST00000064724 WDR62O43379 1518 aa24.84■■□□□ 1.57
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CLDN11-201ENST00000064724 MIA2Q96PC5 1412 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN11-201ENST00000064724 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN11-201ENST00000064724 AKNAQ7Z591 1439 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN11-201ENST00000064724 TONSLQ96HA7 1378 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN11-201ENST00000064724 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CLDN11-201ENST00000064724 DISP1Q96F81 1524 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN11-201ENST00000064724 KIAA0556O60303 1618 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN11-201ENST00000064724 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CLDN11-201ENST00000064724 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.68■■□□□ 1.54
CLDN11-201ENST00000064724 GRIN2AQ12879 1464 aa24.67■■□□□ 1.54
CLDN11-201ENST00000064724 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.65■■□□□ 1.54
CLDN11-201ENST00000064724 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CLDN11-201ENST00000064724 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.62■■□□□ 1.53
CLDN11-201ENST00000064724 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CLDN11-201ENST00000064724 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.61■■□□□ 1.53
CLDN11-201ENST00000064724 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CLDN11-201ENST00000064724 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CLDN11-201ENST00000064724 KCNH8Q96L42 1107 aa24.59■■□□□ 1.53
CLDN11-201ENST00000064724 ROCK1Q13464 1354 aa24.58■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 ARID3CA6NKF2 412 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 KDM6BO15054 1643 aa24.55■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 DAPK1P53355 1430 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 ERCC6Q03468 1493 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 CCER2I3L3R5 266 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 SYNJ2O15056 1496 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 TRIM52Q96A61 297 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN11-201ENST00000064724 ABCC5O15440 1437 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN11-201ENST00000064724 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CLDN11-201ENST00000064724 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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