RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Samd9l	Q69Z37	1561 aa		41.51	■■■■■ 4.24
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Naip1	Q9QWK5	1403 aa		41.5	■■■■■ 4.23
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ap3b1	Q9Z1T1	1105 aa		41.49	■■■■■ 4.23
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dhx29	Q6PGC1	1365 aa	Known RBP	41.49	■■■■■ 4.23
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cux1	P53564	1515 aa		41.46	■■■■■ 4.23
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Las1l	A2BE28	776 aa	Known RBP	41.4	■■■■■ 4.22
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Polr1a	O35134	1717 aa	Known RBP	41.39	■■■■■ 4.22
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slx4	Q6P1D7	1565 aa		41.38	■■■■■ 4.21
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Crocc2	F6XLV1	1638 aa		41.38	■■■■■ 4.21
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mrc2	Q64449	1479 aa		41.36	■■■■■ 4.21
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Urb2	E9Q7L1	1524 aa	Known RBP	41.36	■■■■■ 4.21
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tchh	A0A0B4J1F9	1599 aa		41.34	■■■■■ 4.21
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kif21a	Q9QXL2	1672 aa		41.34	■■■■■ 4.21
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Peg3	Q3URU2	1571 aa		41.34	■■■■■ 4.21
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fyco1	Q8VDC1	1437 aa		41.31	■■■■■ 4.2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cntln	A2AM05	1397 aa		41.31	■■■■■ 4.2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Blm	O88700	1416 aa		41.29	■■■■■ 4.2
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kdm5b	Q80Y84	1544 aa		41.25	■■■■■ 4.19
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rpap1	Q80TE0	1409 aa		41.23	■■■■■ 4.19
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tonsl	Q6NZL6	1363 aa		41.15	■■■■■ 4.18
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rad54l2	Q99NG0	1466 aa		41.15	■■■■■ 4.18
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sall2	Q9QX96	1004 aa		41.14	■■■■■ 4.18
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pla2r1	Q62028	1487 aa		41.01	■■■■■ 4.16
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Eprs	Q8CGC7	1512 aa	Known RBP	40.97	■■■■■ 4.15
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Magi3	Q9EQJ9	1476 aa		40.95	■■■■■ 4.15
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aebp1	Q640N1	1128 aa		40.94	■■■■■ 4.14
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Abca5	Q8K448	1642 aa		40.9	■■■■■ 4.14
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aebp2	Q9Z248	504 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm1043	A0A140LJC2	1431 aa		40.88	■■■■■ 4.13
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wdr66	E9Q743	1299 aa		40.86	■■■■■ 4.13
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Grin2a	P35436	1464 aa		40.84	■■■■■ 4.13
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clspn	Q80YR7	1315 aa		40.83	■■■■■ 4.13
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plb1	Q3TTY0	1478 aa		40.82	■■■■■ 4.13
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lmod2	Q3UHZ5	550 aa		40.8	■■■■■ 4.12
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	3425401B19Rik	D3Z1D3	1412 aa		40.8	■■■■■ 4.12
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gpatch8	A2A6A1	1505 aa		40.8	■■■■■ 4.12
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cadps	Q80TJ1	1355 aa		40.76	■■■■■ 4.12
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Adamts12	Q811B3	1600 aa		40.75	■■■■■ 4.11
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Disp1	Q3TDN0	1521 aa		40.75	■■■■■ 4.11
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm7298	A0A0N4SVU1	1476 aa		40.72	■■■■■ 4.11
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pbrm1	Q8BSQ9	1634 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wiz	O88286	1684 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fhad1	A6PWD2	1420 aa		40.66	■■■■■ 4.1
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mia2	Q91ZV0	1396 aa		40.65	■■■■■ 4.1
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Setd1b	Q8CFT2	1985 aa		40.62	■■■■■ 4.09
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ift140	E9PY46	1464 aa		40.6	■■■■■ 4.09
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lmtk2	Q3TYD6	1471 aa		40.58	■■■■■ 4.09
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam50a	Q9WV03	339 aa	Known RBP	40.57	■■■■■ 4.09
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Soga1	E1U8D0	1418 aa		40.56	■■■■■ 4.08
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vps8	Q0P5W1	1427 aa		40.55	■■■■■ 4.08
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Naip2	Q9QUK4	1447 aa		40.51	■■■■■ 4.08
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Eid3	Q3V124	375 aa		40.51	■■■■■ 4.07
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nup160	Q9Z0W3	1402 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kif27	Q7M6Z4	1394 aa		40.49	■■■■■ 4.07
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gcc2	Q8CHG3	1679 aa		40.48	■■■■■ 4.07
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccer2	J3QPU5	274 aa		40.47	■■■■■ 4.07
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Abca16	E9PWJ7	1678 aa		40.47	■■■■■ 4.07
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ankrd36	D3Z4K0	1415 aa		40.44	■■■■■ 4.06
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccnb3	Q810T2	1396 aa		40.41	■■■■■ 4.06
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	A2m	Q6GQT1	1474 aa		40.4	■■■■■ 4.06
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Neurod1	Q60867	357 aa		40.4	■■■■■ 4.06
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pxdn	Q3UQ28	1475 aa		40.4	■■■■■ 4.06
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrriq1	Q0P5X1	1673 aa		40.34	■■■■■ 4.05
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nexmif	Q5DTT1	1515 aa		40.32	■■■■■ 4.05
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	BC005561	E9Q5E2	1589 aa		40.31	■■■■■ 4.04
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cc2d2b	A0A286YDU8	1405 aa		40.23	■■■■■ 4.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Uaca	Q8CGB3	1411 aa		40.22	■■■■■ 4.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rapgef6	Q5NCJ1	1609 aa		40.19	■■■■■ 4.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wrn	O09053	1401 aa		40.17	■■■■■ 4.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fhod3	Q76LL6	1578 aa		40.16	■■■■■ 4.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Abcc2	Q8VI47	1543 aa		40.12	■■■■■ 4.01
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mug1	P28665	1476 aa		40.09	■■■■■ 4.01
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dennd4b	Q3U1Y4	1499 aa		40.09	■■■■■ 4.01
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cul7	Q8VE73	1689 aa		40.09	■■■■■ 4.01
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Shroom2	A2ALU4	1481 aa		40.05	■■■■■ 4
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppargc1b	Q8VHJ7	1014 aa		40.04	■■■■■ 4
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rfx7	F8VPJ6	1459 aa		40.04	■■■■■ 4
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nop58	Q6DFW4	536 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Arhgef11	Q68FM7	1552 aa		40	■■■■□ 3.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdk11b	P24788	784 aa	Known RBP	39.99	■■■■□ 3.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ncoa3	O09000	1398 aa		39.99	■■■■□ 3.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Arhgap27	A2AB59	869 aa		39.96	■■■■□ 3.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdc42bpa	Q3UU96	1719 aa		39.96	■■■■□ 3.99
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rusc2	Q80U22	1514 aa		39.92	■■■■□ 3.98
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Chic2	Q9D9G3	165 aa		39.92	■■■■□ 3.98
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Camsap2	Q8C1B1	1461 aa		39.9	■■■■□ 3.98
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Anks4b	Q8K3X6	423 aa		39.89	■■■■□ 3.98
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hspa5	P20029	655 aa	Known RBP	39.88	■■■■□ 3.97
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kiaa1551	Q5DTW7	1521 aa		39.88	■■■■□ 3.97
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Map3k4	O08648	1597 aa		39.84	■■■■□ 3.97
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plekhh2	Q8C115	1491 aa		39.84	■■■■□ 3.97
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ncoa2	Q61026	1462 aa		39.83	■■■■□ 3.97
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Abcc5	Q9R1X5	1436 aa		39.83	■■■■□ 3.97
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ncl	P09405	707 aa	Known RBP	39.82	■■■■□ 3.97
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Arhgef40	Q3UPH7	1517 aa		39.8	■■■■□ 3.96
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Setbp1	Q9Z180	1582 aa		39.8	■■■■□ 3.96
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Arhgap31	A6X8Z5	1425 aa		39.78	■■■■□ 3.96
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dhx57	Q6P5D3	1388 aa	Known RBP	39.78	■■■■□ 3.96
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Adcy10	Q8C0T9	1614 aa		39.77	■■■■□ 3.96
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ube2u	B1AUC4	352 aa		39.77	■■■■□ 3.96

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