RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000121491.7

Ttpa-203, Transcript of Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttpa, Length 2,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Eea1Q8BL66 1411 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttpa-203ENSMUST00000121491 BlmO88700 1416 aa17.64■□□□□ 0.41
Ttpa-203ENSMUST00000121491 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Baz1bQ9Z277 1479 aa17.63■□□□□ 0.41
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa17.62■□□□□ 0.41
Ttpa-203ENSMUST00000121491 P3h3Q8CG70 732 aa17.62■□□□□ 0.41
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Slc4a3P16283 1227 aa17.47■□□□□ 0.39
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Slx4Q6P1D7 1565 aa17.41■□□□□ 0.38
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Pcf11G3X9Z4 1553 aa17.31■□□□□ 0.36
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Shroom4Q1W617 1475 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Washc2Q6PGL7 1334 aa17.3■□□□□ 0.36
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Ttpa-203ENSMUST00000121491 TnnQ80Z71 1560 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Ankrd26Q811D2 1581 aa17.28■□□□□ 0.36
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Egfem1Q8C088 590 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Exoc6Q8R313 802 aa17.24■□□□□ 0.35
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa17.19■□□□□ 0.34
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Arhgap27A2AB59 869 aa17.18■□□□□ 0.34
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa17.18■□□□□ 0.34
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Cux1P53564 1515 aa17.17■□□□□ 0.34
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa17.15■□□□□ 0.34
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Aebp1Q640N1 1128 aa17.12■□□□□ 0.33
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Naip2Q9QUK4 1447 aa17.12■□□□□ 0.33
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 A2mQ6GQT1 1474 aa17.09■□□□□ 0.33
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa17.09■□□□□ 0.33
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 Gm13695A2AK44 830 aa16.99■□□□□ 0.31
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Ttpa-203ENSMUST00000121491 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Cabp1Q9JLK7 227 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Usp47Q8BY87 1376 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Crocc2F6XLV1 1638 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Carmil1Q6EDY6 1374 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Ncoa1P70365 1447 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Wdr62Q3U3T8 1523 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Rgl3Q3UYI5 709 aa16.94■□□□□ 0.3
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Pprc1Q6NZN1 1644 aa16.94■□□□□ 0.3
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Ttpa-203ENSMUST00000121491 Plcd4Q8K3R3 807 aa16.93■□□□□ 0.3
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