RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000118545.7

Sh3bp2-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp2, Length 3,034 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Eea1Q8BL66 1411 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ubl4bQ9CQ84 188 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 PtprkP35822 1457 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Arhgap35Q91YM2 1499 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 BlmO88700 1416 aa22.45■■□□□ 1.19
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Kdm5bQ80Y84 1544 aa22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ube2uB1AUC4 352 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Wdr62Q3U3T8 1523 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Stra8P70278 393 aa22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 PrkcshO08795 521 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 P3h3Q8CG70 732 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Supt16hQ920B9 1047 aa22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Cux2P70298 1426 aa22.2■■□□□ 1.15
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Naip1Q9QWK5 1403 aa22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Gm13697A2AK42 830 aa22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Chic2Q9D9G3 165 aa22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 TnnQ80Z71 1560 aa22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 NrkQ9R0G8 1455 aa22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Pak3Q61036 559 aa22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Lamc3Q9R0B6 1581 aa22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Slc4a3P16283 1227 aa22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Tiam1Q60610 1591 aa22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Mrs2Q5NCE8 434 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Shroom4Q1W617 1475 aa22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Slx4Q6P1D7 1565 aa22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa22■■□□□ 1.11
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Grin2bQ01097 1482 aa22■■□□□ 1.11
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 UacaQ8CGB3 1411 aa21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Rtl5Q5DTT4 599 aa21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Pcf11G3X9Z4 1553 aa21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Washc2Q6PGL7 1334 aa21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ankrd26Q811D2 1581 aa21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 NrdcQ8BHG1 1161 aa21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Map3k1P53349 1493 aa21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Liat1Q810M6 228 aa21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Exoc6Q8R313 802 aa21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Kcnh8P59111 1102 aa21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ccer2J3QPU5 274 aa21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Fhad1A6PWD2 1420 aa21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Rad54l2Q99NG0 1466 aa21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Mia2Q91ZV0 1396 aa21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Duox2A2AQ99 1517 aa21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Erich3F6QRE9 1637 aa21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Aebp1Q640N1 1128 aa21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 CntlnA2AM05 1397 aa21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Egfem1Q8C088 590 aa21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Cux1P53564 1515 aa21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Fyco1Q8VDC1 1437 aa21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Naip5Q9R016 1403 aa21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Vps8Q0P5W1 1427 aa21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Naip2Q9QUK4 1447 aa21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Zfp644E9QA22 1323 aa21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Arhgap27A2AB59 869 aa21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Mphosph9A6H5Y1 991 aa21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Efcab5A0JP43 1406 aa21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ncoa2Q61026 1462 aa21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 A2mQ6GQT1 1474 aa21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Carmil1Q6EDY6 1374 aa21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ofd1Q80Z25 1017 aa21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ccnb3Q810T2 1396 aa21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Zbtb4Q5F293 982 aa21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Pkd2O35245 966 aa21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Gm13695A2AK44 830 aa21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 L3mbtl2P59178 703 aa21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Cabp1Q9JLK7 227 aa21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Samd9lQ69Z37 1561 aa21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 Ccdc27Q3V036 639 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms