RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif21aQ9QXL2 1672 aa13.3□□□□□ -0.28
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpap1Q80TE0 1409 aa13.27□□□□□ -0.28
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map3k1P53349 1493 aa13.24□□□□□ -0.29
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sall2Q9QX96 1004 aa13.23□□□□□ -0.29
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plb1Q3TTY0 1478 aa13.21□□□□□ -0.29
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa13.2□□□□□ -0.3
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Carmil1Q6EDY6 1374 aa13.19□□□□□ -0.3
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cep162Q6ZQ06 1403 aa13.17□□□□□ -0.3
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PtprkP35822 1457 aa13.16□□□□□ -0.3
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SynmQ70IV5 1561 aa13.14□□□□□ -0.31
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam71e1A1L3C1 212 aa13.13□□□□□ -0.31
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc24a1Q91WD8 1130 aa13.13□□□□□ -0.31
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Disp1Q3TDN0 1521 aa13.06□□□□□ -0.32
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Samd9lQ69Z37 1561 aa13.01□□□□□ -0.33
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eea1Q8BL66 1411 aa13□□□□□ -0.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Shroom2A2ALU4 1481 aa12.99□□□□□ -0.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa12.98□□□□□ -0.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa12.96□□□□□ -0.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zbtb4Q5F293 982 aa12.96□□□□□ -0.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Setd5Q5XJV7 1441 aa12.94□□□□□ -0.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NefmP08553 848 aa12.93□□□□□ -0.34
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgap27A2AB59 869 aa12.89□□□□□ -0.35
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CntlnA2AM05 1397 aa12.88□□□□□ -0.35
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa12.82□□□□□ -0.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map3k4O08648 1597 aa12.81□□□□□ -0.36
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif27Q7M6Z4 1394 aa12.8□□□□□ -0.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm13697A2AK42 830 aa12.75□□□□□ -0.37
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arap1Q4LDD4 1452 aa12.73□□□□□ -0.37
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa12.72□□□□□ -0.37
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Erich6D3Z6S9 713 aa12.72□□□□□ -0.37
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa12.71□□□□□ -0.38
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abca16E9PWJ7 1678 aa12.7□□□□□ -0.38
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Setd1bQ8CFT2 1985 aa12.7□□□□□ -0.38
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PxdnQ3UQ28 1475 aa12.69□□□□□ -0.38
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa12.69□□□□□ -0.38
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam163aQ8CAA5 168 aa12.68□□□□□ -0.38
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Peg3Q3URU2 1571 aa12.67□□□□□ -0.38
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