RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.69■■□□□ 1.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stra8P70278 393 aa22.66■■□□□ 1.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa22.66■■□□□ 1.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.66■■□□□ 1.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NrkQ9R0G8 1455 aa22.65■■□□□ 1.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Shroom4Q1W617 1475 aa22.64■■□□□ 1.22
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cux1P53564 1515 aa22.34■■□□□ 1.17
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13697A2AK42 830 aa22.28■■□□□ 1.16
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rad54l2Q99NG0 1466 aa22.25■■□□□ 1.15
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.16■■□□□ 1.14
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Supt16hQ920B9 1047 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mphosph9A6H5Y1 991 aa22.12■■□□□ 1.13
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Erich3F6QRE9 1637 aa22.08■■□□□ 1.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Naip2Q9QUK4 1447 aa22.07■■□□□ 1.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22.06■■□□□ 1.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A2mQ6GQT1 1474 aa22.06■■□□□ 1.12
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa22.05■■□□□ 1.12
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp47Q8BY87 1376 aa21.9■■□□□ 1.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CadpsQ80TJ1 1355 aa21.88■■□□□ 1.09
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pak3Q61036 559 aa21.87■■□□□ 1.09
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 WrnO09053 1401 aa21.8■■□□□ 1.08
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