RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	SUR7	P54003	302 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	DON1	Q05610	365 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	PSK2	Q08217	1101 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	DAL7	P21826	554 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	SWI3	P32591	825 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	EXO1	P39875	702 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	RSB1	Q08417	382 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	DDC1	Q08949	612 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	RKM5	Q12367	367 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	PNS1	Q12412	539 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	GIS3	Q12418	502 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	PMT7	Q06644	662 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	SVS1	Q12254	260 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL296W	YNL296W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RPL43B	P0CX26	92 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	CHS2	P14180	963 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RRT12	P25381	491 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	VBA3	P25594	458 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	PXA2	P34230	853 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	TTI1	P36097	1038 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	VBA5	P36172	582 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YJL070C	P40361	888 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	LCB2	P40970	561 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	PFD1	P46988	109 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YJR079W	P47126	109 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	PIR3	Q03180	325 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RSM10	Q03201	203 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RPN4	Q03465	531 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YML096W	Q04489	525 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	HRD3	Q05787	833 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	THI73	Q07904	523 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	MLH2	Q07980	695 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	NDD1	Q08887	554 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YDR061W	Q12298	539 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	TRS33	Q99394	268 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	IME1	P21190	360 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YKL151C	P36059	337 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	PCA1	P38360	1216 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	BST1	P43571	1029 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	TIM8	P57744	87 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YPL113C	Q02961	396 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	LCB4	Q12246	624 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	MED1	Q12321	566 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	BEM1	P29366	551 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YBR053C	P38235	358 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RFC5	P38251	354 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	SER33	P40510	469 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YGL140C	P53120	1219 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RSC1	P53236	928 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	CTM1	P38818	585 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	CTF18	P49956	741 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	YLR012C	Q07927	99 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	TRE1	Q08919	783 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	RTT10	Q08924	1013 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	HMI1	Q12039	706 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	PER33	Q12144	273 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	ARP7	Q12406	477 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	SEC63	P14906	663 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	CWP1	P28319	239 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	CBF2	P32504	956 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	SEC6	P32844	805 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL296W	YNL296W	CEM1	P39525	442 aa		5.17	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.4 ms