RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	YPT10	P38146	199 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	YEL025C	P39991	1188 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	BST1	P43571	1029 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	YJR142W	P47173	342 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	UME1	Q03010	460 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	TDA9	Q04545	1251 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	ARR3	Q06598	404 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	PCL8	Q08966	492 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	NUP145	P49687	1317 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	HMG2	P12684	1045 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	HXT4	P32467	576 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	SAP4	P53036	818 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	RSC9	Q03124	581 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	NSE5	Q03718	556 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	ORM2	Q06144	216 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	YDL073W	Q07454	984 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	PCK1	P10963	549 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	WHI2	P12611	486 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	HOP1	P20050	605 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	LRO1	P40345	661 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	RPC34	P32910	317 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	HLR1	Q04429	423 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	AIM41	Q12032	185 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	NMD5	P46970	1048 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	WAR1	Q03631	944 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	YLR111W	Q12528	110 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	DGR2	P32330	852 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	OPT1	P40897	799 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.47	□□□□□ -1.85	not detected
YKL063C	YKL063C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	CCL1	P37366	393 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	USA1	Q03714	838 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	APM4	Q99186	491 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKL063C	YKL063C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	VPS33	P20795	691 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YJL193W	P39542	402 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	SAE2	P46946	345 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	PMT3	P47190	753 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YGR237C	P50089	785 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	TGS1	Q12052	315 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.46	□□□□□ -1.86	not detected
YKL063C	YKL063C	LOT5	P34234	306 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	DID4	P36108	232 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	BRN1	P38170	754 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YPL068C	Q02749	293 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	BSP1	Q06604	576 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	IRC3	Q06683	689 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	GSY2	P27472	705 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	DSS4	P32601	143 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	STB5	P38699	743 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YEL076C	P39971	216 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	EAF5	P39995	279 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	TDA10	P42938	290 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	SNO3	P43544	222 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YNL092W	P53934	400 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	GDA1	P32621	518 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	MEP2	P41948	499 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YPL071C	Q02864	156 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YML119W	Q03208	357 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	HRD3	Q05787	833 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	TPO3	Q06451	622 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	CYK3	Q07533	885 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YOR378W	Q08902	515 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YPR027C	Q12079	277 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	HER1	Q12276	1246 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	CRC1	Q12289	327 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	BET2	P20133	325 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	FLO5	P38894	1075 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86

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