RNA–Protein interactions for RNA: YGR212W

SLI1, Transcript of N-acetyltransferase, yeast

Gene SLI1, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLI1	YGR212W	TPM2	P40414	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	GAT1	P43574	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	PHM6	Q05637	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
SLI1	YGR212W	GCN2	P15442	1659 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	KRE5	P22023	1365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	VID28	P40547	921 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	COX18	P53239	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	YPS7	Q06325	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	ATP12	P22135	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	PET127	P32606	800 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	SEC6	P32844	805 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	DUN1	P39009	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	NDC80	P40460	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	SCS3	P53012	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	RIM13	Q03792	727 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	PEX15	Q08215	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	NUP192	P47054	1683 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	ATP4	P05626	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	CDC26	P14724	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	UBS1	P38290	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	YNL195C	P40168	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	IES1	P43579	692 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	RPN13	O13563	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	VPS36	Q06696	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	STP4	Q07351	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	NYV1	Q12255	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	IME1	P21190	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	DGR2	P32330	852 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	NIC96	P34077	839 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	BAP3	P41815	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	MTL1	P53214	551 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	YAP1802	P53309	568 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	ECM3	Q99252	613 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLI1	YGR212W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
SLI1	YGR212W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	HXT4	P32467	576 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	YPT7	P32939	208 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	SFB3	P38810	929 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	LYS9	P38999	446 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	GET2	P40056	285 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	PXA1	P41909	870 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	HOL1	P53389	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	MET14	Q02196	202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	SSM4	P40318	1319 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	SIR3	P06701	978 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	PEX1	P24004	1043 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	BUD8	P41698	603 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	IRC5	P43610	853 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	BIT61	P47041	543 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	TAF4	P50105	388 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	NSE5	Q03718	556 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	OSW1	Q08692	278 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	GAL1	P04385	528 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	VPS34	P22543	875 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	KCC4	P25389	1037 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	NUP60	P39705	539 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	BDH2	P39713	417 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	EAF5	P39995	279 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	PIP2	P52960	996 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	PPN1	Q04119	674 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	SEG1	Q04279	960 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	POM34	Q12445	299 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	KIN82	P25341	720 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLI1	YGR212W	YKL133C	P36066	463 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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