RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W MUB1Q03162 620 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W CCE1Q03702 353 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YPR097WQ06839 1073 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RPO26P20435 155 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PRI2P20457 528 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W OPI1P21957 404 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SWI3P32591 825 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W IME1P21190 360 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ARE1P25628 610 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PAT1P25644 796 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W NTH1P32356 751 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W DPH2P32461 534 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W DOT6P40059 670 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W KXD1P53158 218 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FOL1P53848 824 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PML39Q03760 334 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FIG2P25653 1609 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PHO4P07270 312 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RPC53P25441 422 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W MSH1P25846 959 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YKL102CP34249 101 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ALG3P38179 458 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W NUP60P39705 539 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W EAF5P39995 279 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W NUP85P46673 744 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YGR237CP50089 785 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TIM10P87108 93 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FRA1Q07825 749 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TRE2Q08693 809 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W BAS1P22035 811 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W MEI4P29467 408 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W BCK2P33306 851 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YKL097CP34245 136 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W INP51P40559 946 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W BUD6P41697 788 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YJR115WP47152 169 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TYW3P53177 273 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ERP6P53198 216 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W MUK1Q02866 612 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SPO21Q12411 609 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W HSF1P10961 833 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W STE11P23561 717 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W KIP2P28743 706 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ISC10P32645 267 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W CSE2P33308 149 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W MRP8P35719 219 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FMP23P38231 175 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SUT1P53032 299 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YGR021WP53212 290 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SSL2Q00578 843 aa3.1□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W HOM3P10869 527 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PUP2P32379 260 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SIP3P38717 1229 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SRB7P47822 140 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W UBX4P54730 416 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YFT2Q06676 274 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YPT1P01123 206 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W GDA1P32621 518 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FYV8P46949 817 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W UBA2P52488 636 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W MEH1Q02205 184 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SFI1Q12369 946 aa3.09□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W CYC8P14922 966 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HSP78P33416 811 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MCM7P38132 845 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W GND1P38720 489 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HOS4P40480 1083 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W BRE2P43132 505 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W VTC4P47075 721 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YNL011CP53980 444 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HUA2Q12134 243 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W NSI1Q12457 570 aa3.09□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W DAL7P21826 554 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W VAC17P25591 423 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YCR102CP25608 368 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W UTH1P36135 365 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W ALG11P53954 548 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MRP7P12687 371 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RGP1P16664 663 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PHO81P17442 1178 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W UBP9P39967 754 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YER188WP40103 239 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W UBP7P40453 1071 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CTF18P49956 741 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CDC55Q00362 526 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SAM3Q08986 587 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TMA17Q12513 150 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YOL087CQ99247 1116 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HIR1P32479 840 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W NIP1P32497 812 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W VRP1P37370 817 aa3.08□□□□□ -1.92
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