RNA–Protein interactions for RNA: YMR134W

ERG29, Transcript of Protein of unknown function involved in ergosterol biosynthesis, yeast

Gene ERG29, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ERG29	YMR134W	ORM2	Q06144	216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	MGS1	P40151	587 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	YIP4	P53093	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	SWI6	P09959	803 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	PMA2	P19657	947 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	TDA3	P38758	523 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	FDC1	Q03034	503 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	PPN1	Q04119	674 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	STP4	Q07351	490 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	ZPS1	Q12512	249 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	PIH1	P38768	344 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	PPE1	P38796	400 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	RET2	P43621	546 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	MFM1	Q02783	413 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	CIR2	Q08822	631 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	FRE7	Q12333	620 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERG29	YMR134W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	MRPL7	P36519	292 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	TIM50	Q02776	476 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	IRC3	Q06683	689 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	PRE4	P30657	266 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
ERG29	YMR134W	ATG36	P46983	293 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	ATP23	P53722	227 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	GEP3	Q08622	556 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	TUP1	P16649	713 aa		5	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	YUR1	P26725	428 aa		5	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	BEM3	P32873	1128 aa		5	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	CNE1	P27825	502 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	CKB2	P38930	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	DUN1	P39009	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	FTR1	P40088	404 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	TAF4	P50105	388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	COQ6	P53318	479 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	BUD17	P53727	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	YNL018C	P53976	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	HLR1	Q04429	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	IES1	P43579	692 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	CDS1	P38221	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	YJR096W	P47137	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	NSE5	Q03718	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ERG29	YMR134W	WHI2	P12611	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
ERG29	YMR134W	MRPL9	P31334	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	RPC34	P32910	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	PRM2	P40534	656 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	YGR153W	P48238	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	YTA7	P40340	1379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	SEC65	P29478	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	SFP1	P32432	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	NMD5	P46970	1048 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	YJL043W	P47053	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	HXT7	P39004	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	HOP1	P20050	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	APD1	P38281	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	SNO3	P43544	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	STB2	P46679	850 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	ALG12	P53730	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	LOT5	P34234	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	BST1	P43571	1029 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	YFL015C	P43578	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	ECM9	Q02202	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	RSC9	Q03124	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	AIM41	Q12032	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	TSR4	P25040	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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