RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	APE4	P38821	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
VMA22	YHR060W	CRD1	Q07560	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	HOS1	Q12214	470 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	PCK1	P10963	549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	APL1	P27351	700 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	ELM1	P32801	640 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SRP101	P32916	621 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	APT2	P36973	181 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	AXL2	P38928	823 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	PZF1	P39933	429 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	CIR1	P42940	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SSY5	P47002	699 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	AVT1	P47082	602 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	YML6	P51998	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	YGR012W	P53206	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	MRPL22	P53881	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	ARP4	P80428	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	YKU80	Q04437	629 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	XYL2	Q07993	356 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SPT7	P35177	1332 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	CWH43	P25618	953 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	DBF4	P32325	704 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	CBF2	P32504	956 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	RPD3	P32561	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	PET127	P32606	800 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	YHR078W	P38799	552 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	IMA5	P40884	581 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	MDR1	P53258	950 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	BSC5	P53755	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	TAF11	Q04226	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SKM1	Q12469	655 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	BET2	P20133	325 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	YKL100C	P34248	587 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	MAD2	P40958	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	TAF4	P50105	388 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	TEL2	P53038	688 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	MNT2	P53059	558 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	AAD4	Q07747	329 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA22	YHR060W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	GCN4	P03069	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	FBP1	P09201	348 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RED1	P14291	827 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	MET8	P15807	274 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SWC3	P31376	625 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ANP1	P32629	500 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SAS3	P34218	831 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YHR033W	P38690	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CTF8	P38877	133 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	IRC24	P40580	263 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PXA1	P41909	870 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	IMA1	P53051	589 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PEF1	P53238	335 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YNR071C	P53757	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	REC102	Q02721	264 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ATG21	Q02887	496 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	MSC2	Q03455	724 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CDA1	Q06702	301 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SGO1	Q08490	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	TRM8	Q12009	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	HUA2	Q12134	243 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	TPK1	P06244	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CMP2	P14747	604 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SPO16	P17122	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PRE8	P23639	250 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RIT1	P23796	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SGF29	P25554	259 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CAJ1	P39101	391 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SDP1	P40479	209 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CAB2	P40506	365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	AXL1	P40851	1208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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