RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.44□□□□□ -1.54not detected
PRD1YCL057W GAD1Q04792 585 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W ATP4P05626 244 aa5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W PET127P32606 800 aa5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W APT2P36973 181 aa5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W TPM2P40414 161 aa5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W VID28P40547 921 aa5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W RNR4P49723 345 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W RTS3P53289 263 aa5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W PHM6Q05637 104 aa5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W PEX15Q08215 383 aa5.43□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W LAT1P12695 482 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W RNR1P21524 888 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W MSP1P28737 362 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W MF(ALPHA)2P32435 120 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W VPS24P36095 224 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W UBP5P39944 805 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W AMA1P50082 593 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W STP4Q07351 490 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W VHS3Q08438 674 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W MPD2Q99316 277 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W KAR1P11927 433 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W FRS1P15624 595 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YBR053CP38235 358 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W HOS4P40480 1083 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YIL092WP40497 633 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W NOP9P47077 666 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W HAP1P0CE41 1502 aa5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data5.41□□□□□ -1.54not detected
PRD1YCL057W CTS1P29029 562 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W SEC6P32844 805 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W LYS9P38999 446 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YNL195CP40168 261 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W GET2P40056 285 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YIR042CP40586 236 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W MUP1P50276 574 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W PHO23P50947 330 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W DLT1Q04216 342 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W VPS36Q06696 566 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W TRM13Q12383 476 aa5.41□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W SST2P11972 698 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W ELO3P40319 345 aa5.4□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W MTL1P53214 551 aa5.4□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W DEF1P35732 738 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W RSC8P43609 557 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W IRC5P43610 853 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W BIT61P47041 543 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W NTO1Q12311 748 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W EDE1P34216 1381 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W MET3P08536 511 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W CAF20P12962 161 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W HCM1P25364 564 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W HXT4P32467 576 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W HIR1P32479 840 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W SRP68P38687 599 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W BUD8P41698 603 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W THI22Q06490 572 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W RAD9P14737 1309 aa5.39□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W MET5P47169 1442 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W HCA4P20448 770 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PEX1P24004 1043 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W EFT1P32324 842 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W SHM2P37291 469 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W MET14Q02196 202 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W NSE5Q03718 556 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W SGO1Q08490 590 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W YML133CQ03099 1374 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W YLL067CQ07888 1374 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W YLL066CQ99208 1374 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W TRM3Q07527 1436 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W NIC96P34077 839 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W RRP8P38961 392 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W DUN1P39009 513 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W ENP2P48234 707 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W COX18P53239 316 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W ECM3Q99252 613 aa5.38□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W ERG20P08524 352 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W ERG4P25340 473 aa5.37□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PRD1P25375 712 aa5.37□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W KTR4P38131 464 aa5.37□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W DAS1P47005 663 aa5.37□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W CNM67P53865 581 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W KRE5P22023 1365 aa5.37□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W FMO1P38866 432 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W NUP60P39705 539 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PXA1P41909 870 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W TAF4P50105 388 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms