RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	SNZ2	P53824	298 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YNL058C	P53947	316 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	FMN1	Q03778	218 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ECM7	Q06200	448 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	MDM38	Q08179	573 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SPE4	Q12455	300 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ECM3	Q99252	613 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RIF1	P29539	1916 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	IMA3	P0CW40	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	IMA4	P0CW41	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SLY1	P22213	666 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	KIN82	P25341	720 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SPS22	P25380	463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
UBX7	YBR273C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SEC6	P32844	805 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SWC5	P38326	303 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ISM1	P48526	1002 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ORC5	P50874	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	MIG2	P53035	382 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YGR125W	P53273	1036 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	FPK1	P53739	893 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YNL146W	P53906	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	IMA2	Q08295	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YLR053C	Q12026	108 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	OCA6	Q12454	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	AVL9	Q12500	764 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SNA3	P14359	133 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PUT4	P15380	627 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	AAD3	P25612	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	IRE1	P32361	1115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GYP6	P32806	458 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ETR1	P38071	380 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	MMS4	P38257	691 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ERP2	P39704	215 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	EAF5	P39995	279 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SCC4	P40090	624 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	KHA1	P40309	873 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	FET4	P40988	552 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YJL107C	P42947	387 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YJL045W	P47052	634 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CTR1	P49573	406 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YDR090C	Q03193	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ADY3	Q07732	790 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YIG1	Q08956	461 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	HFI1	Q12060	488 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TAF3	Q12297	353 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PCD1	Q12524	340 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	FBP1	P09201	348 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GPA2	P10823	449 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RRT12	P25381	491 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	NUD1	P32336	851 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	UTR4	P32626	227 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SHP1	P34223	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	REG2	P38232	338 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CKB2	P38930	258 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	FRT2	P39734	528 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SAW1	P39735	261 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YJL007C	P47080	104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	JJJ3	P47138	172 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RSM26	P47141	266 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	NUT1	P53114	1132 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	COS6	P53344	381 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CDC55	Q00362	526 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TRS130	Q03660	1102 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RUP1	Q12242	671 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	MOT1	P32333	1867 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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