RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	RTT107	P38850	1070 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	BOP3	P53958	396 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MMR1	Q06324	491 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	TFC6	Q06339	672 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MCA1	Q08601	432 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	AFT2	Q08957	416 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	HMI1	Q12039	706 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ATG9	Q12142	997 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	CEX1	Q12453	761 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	TMA17	Q12513	150 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YOL087C	Q99247	1116 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.13	□□□□□ -1.43	not detected
PSH1	YOL054W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	FUN30	P31380	1131 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	HIR1	P32479	840 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MDL2	P33311	773 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RXT2	P38255	430 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	CTM1	P38818	585 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SEC9	P40357	651 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	CIT3	P43635	486 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RTC4	P53850	401 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ATP25	Q03153	612 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RSC3	Q06639	885 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MET7	Q08645	548 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ENV7	Q12003	364 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YVC1	Q12324	675 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MPH2	P0CD99	609 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ALG1	P16661	449 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SEC65	P29478	273 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ANP1	P32629	500 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MTC2	P34246	357 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YET1	P35723	206 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MYO3	P36006	1272 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	BYE1	P36106	594 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	GIC1	P38785	314 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MGS1	P40151	587 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	PCI8	P40512	444 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	EFM4	P40516	257 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	HDA1	P53973	706 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ERG5	P54781	538 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	GYL1	Q04322	720 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	HFD1	Q04458	532 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	INM2	Q05533	292 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	VAC14	Q06708	880 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	REH1	Q06709	432 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	THI3	Q07471	609 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	OSW2	Q12202	724 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	FIG2	P25653	1609 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	NFU1	P32860	256 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	CAF16	P43569	289 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	VTC3	Q02725	835 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ATG23	Q06671	453 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	TIP41	Q12199	356 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	NSI1	Q12457	570 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SFL1	P20134	766 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ACE2	P21192	770 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MAK31	P23059	88 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	PCL2	P25693	308 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MGM1	P32266	881 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RPC82	P32349	654 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SRB4	P32569	687 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	CNS1	P33313	385 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MED8	P38304	223 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RTS1	P38903	757 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SPT8	P38915	602 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	VPS8	P39702	1274 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	ECM1	P39715	212 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	NIT1	P40447	199 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	LYS14	P40971	790 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	PRY1	P47032	299 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YMR102C	Q03177	834 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	OMS1	Q06668	471 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	GUD1	Q07729	489 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RSC58	Q07979	502 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SVS1	Q12254	260 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MTF2	P10849	440 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SAM35	P14693	329 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	PER1	P25625	357 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43

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