RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	YGL081W	P53156	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	PET127	P32606	800 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	BEM4	P39011	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	YHM2	Q04013	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	POM34	Q12445	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	KIN82	P25341	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	DMC1	P25453	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	SEC65	P29478	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	YKU70	P32807	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	BCS1	P32839	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	BIT2	P38346	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	DUN1	P39009	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	YJL206C	P39529	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	THI22	Q06490	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	VPS36	Q06696	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	USV1	Q12132	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	ABF1	P14164	731 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	PRP28	P23394	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	DID4	P36108	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	GLG1	P36143	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	FHN1	P53279	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	ATG4	P53867	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	ECM9	Q02202	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	MLH3	Q12083	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	YIL077C	P40508	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	PXA1	P41909	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	GPG1	P53130	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	SWI6	P09959	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	NTH1	P32356	751 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	TDP1	P38319	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	YEN1	P40028	759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	BIT61	P47041	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	PPN1	Q04119	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	COS111	P38308	924 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	RFX1	P48743	811 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	YPS7	Q06325	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR070W	YKR070W	RPO31	P04051	1460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	OAF3	P36023	863 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	HXT7	P39004	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	UBP12	P39538	1254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	MPS3	P47069	682 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	YGR151C	P53287	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	YFT2	Q06676	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	HFI1	Q12060	488 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	TSR4	P25040	408 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	FUB1	P25659	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	BDH2	P39713	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	SPC98	P53540	846 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	KCC4	P25389	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	SET3	P36124	751 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	GMH1	P36125	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	APL3	P38065	1025 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	CTP1	P38152	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	BUD8	P41698	603 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	RMP1	Q12530	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	SSK2	P53599	1579 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	DGR2	P32330	852 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	SEC6	P32844	805 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	PPZ2	P33329	710 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	KHA1	P40309	873 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	YIL166C	P40445	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	VID28	P40547	921 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	TAF4	P50105	388 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	NMA2	P53204	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	SPO1	P53541	631 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	STP4	Q07351	490 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
YKR070W	YKR070W	TAF3	Q12297	353 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms