RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	MSS4	P38994	779 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	VID27	P40157	782 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	TPM2	P40414	161 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	LSB1	P53281	241 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	SLI1	P53304	468 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RTC4	P53850	401 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RAD53	P22216	821 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RIT1	P23796	513 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	ROX1	P25042	368 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	AFR1	P33304	620 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YRO2	P38079	344 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YBR184W	P38299	523 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	PEA2	P40091	420 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	SOL4	P53315	255 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	TFC6	Q06339	672 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	FLO11	P08640	1367 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	SAS3	P34218	831 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RXT2	P38255	430 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	SIT1	P39980	628 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	VID28	P40547	921 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	NPA3	P47122	385 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CTF18	P49956	741 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	TPO2	P53283	614 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	FOL1	P53848	824 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	UPC2	Q12151	913 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	TIP41	Q12199	356 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	PER1	P25625	357 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YKR018C	P36114	725 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YBL028C	P38202	106 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	VPS45	P38932	577 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	VAB2	P40003	282 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	VPS30	Q02948	557 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	PEX19	Q07418	342 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	ENB1	Q08299	606 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	LAS17	Q12446	633 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CSR2	Q12734	1121 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	NUC1	P08466	329 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	KAR4	P25583	335 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	MAL33	P38157	468 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CHS7	P38843	316 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	PFD1	P46988	109 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RET3	P53600	189 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	MDM1	Q01846	1127 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	AIM39	Q08223	395 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	DSE3	Q08729	430 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	GSC2	P40989	1895 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CIT1	P00890	479 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CBP1	P07252	654 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	ALG1	P16661	449 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CLC1	P17891	233 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	OCT1	P35999	772 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	LYS14	P40971	790 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	VPS4	P52917	437 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	YGL138C	P53122	345 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	CSM3	Q04659	317 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	GUP2	Q08929	609 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	GIN4	Q12263	1142 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CPR4	YCR069W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SED4	P25365	1065 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	RPN12	P32496	274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	STE14	P32584	239 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	STE13	P33894	931 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	STV1	P37296	890 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	CIR1	P42940	261 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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