RNA–Protein interactions for RNA: YLL053C

YLL053C, Transcript of Putative protein, yeast

Gene YLL053C, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL053C	YLL053C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	ZRT2	Q12436	422 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	LDB19	Q12502	818 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	CSE2	P33308	149 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	YMC2	P38087	329 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	MND1	P53102	219 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	YPL034W	Q03083	165 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	ECM30	Q06673	1274 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.74	□□□□□ -0.53	not detected
YLL053C	YLL053C	VBA3	P25594	458 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	VBA5	P36172	582 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	TBS1	P38114	1094 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	GEM1	P39722	662 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	RPC17	P47076	161 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	YJR054W	P47114	497 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	HOP2	P53187	214 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.73	□□□□□ -0.53	not detected
YLL053C	YLL053C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	TRE1	Q08919	783 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	SDH2	P21801	266 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	MRP4	P32902	394 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	HEL1	P36113	551 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	YGR035C	P53222	116 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	AIM41	Q12032	185 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	NUR1	Q12066	484 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	KAR3	P17119	729 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	BRL1	P38770	471 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	ESL1	P40456	1118 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	ASG7	P46993	209 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	FMP30	Q02883	468 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YLL053C	YLL053C	JIP3	O13555	125 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	LTV1	P34078	463 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	YBL036C	P38197	257 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	TMN3	P40071	706 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	DSE1	P40077	573 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SNZ3	P43545	298 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SPO74	P45819	413 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	POL31	P46957	487 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	RIM8	P53179	542 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SNZ2	P53824	298 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	STP1	Q00947	519 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	YMR187C	Q03236	431 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	TDA9	Q04545	1251 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	VPS3	P23643	1011 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	BIO2	P32451	375 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	FRE1	P32791	686 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SEG2	P34250	1132 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	KDX1	P36005	433 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	AVT3	P36062	692 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	POA1	P38218	177 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	MUB1	Q03162	620 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	ARO80	Q04052	950 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	UFO1	Q04511	668 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	VPS54	Q12071	889 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	REC8	Q12188	680 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	EMP46	Q12396	444 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	CDC8	P00572	216 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SLX1	P38324	304 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	MMS21	P38632	267 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SAK1	P38990	1142 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	END3	P39013	349 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	IVY1	Q04934	453 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	ESC8	Q08119	714 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	TPK1	P06244	397 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	CIT2	P08679	460 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	PUT4	P15380	627 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SFL1	P20134	766 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	APM2	P38700	605 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	MIC19	P43594	170 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	SPC98	P53540	846 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	GAL80	P04387	435 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	PMS1	P14242	873 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YLL053C	YLL053C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 74.2 ms