RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	IAH1	P41734	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	SPR3	P41901	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	PHO86	P46956	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	YDR090C	Q03193	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	HFI1	Q12060	488 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	IXR1	P33417	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	OAF3	P36023	863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	VID24	P38263	362 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	YIL089W	P40500	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	NMD5	P46970	1048 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	JJJ3	P47138	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	NDL1	Q06568	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	FRA1	Q07825	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	TRM11	Q12463	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	YER152C	P10356	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	PEP5	P12868	1029 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	TIM23	P32897	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	ECM4	P36156	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
KAR2	YJL034W	MMS4	P38257	691 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	FZO1	P38297	855 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	VHC1	P38329	1120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	MSG5	P38590	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	ASG1	P40467	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	AIM21	P40563	679 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	UFO1	Q04511	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	PNP1	Q05788	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	ECM3	Q99252	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR2	YJL034W	MOT1	P32333	1867 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PDR1	P12383	1068 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	POL3	P15436	1097 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SFL1	P20134	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SCJ1	P25303	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	KIN82	P25341	720 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PHO87	P25360	923 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YCR051W	P25631	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	BUD2	P33314	1104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SEG2	P34250	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	CCL1	P37366	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
KAR2	YJL034W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YMR134W	P40207	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	AIM20	P40451	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	URB2	P47108	1174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SHR3	Q02774	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	USA1	Q03714	838 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	IVY1	Q04934	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	FAR8	Q05040	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PIG1	Q06216	648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SHS1	Q07657	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
KAR2	YJL034W	RRT12	P25381	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YBR062C	P38239	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	POP4	P38336	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SSP1	P38871	571 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ATG36	P46983	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ACF4	P47129	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PCL10	P53124	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ERP6	P53198	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	JIP4	Q03361	876 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TAF9	Q05027	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	OSW1	Q08692	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	BI2	P03873	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	BI4	P03879	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	GCR1	P07261	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	RAD16	P31244	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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