RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	FMP52	P40008	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	GET2	P40056	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	BAP3	P41815	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YJR096W	P47137	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	REC102	Q02721	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	TMN2	Q04562	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	SPC42	P36094	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YKR075C	P36155	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	REV7	P38927	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	GND2	P53319	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	RIA1	P53893	1110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	SGO1	Q08490	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
RSM27	YGR215W	CKB2	P38930	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	NUP60	P39705	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	BFA1	P47113	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	TEL2	P53038	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	GID8	P40208	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YGR153W	P48238	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	UME1	Q03010	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	AIM44	Q99299	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	MTH1	P35198	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	MAL31	P38156	614 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	SDS3	P40505	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	RET2	P43621	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	PMT3	P47190	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	SSL2	Q00578	843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	PHO11	P35842	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	PHO12	P38693	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YGR237C	P50089	785 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	VPS36	Q06696	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	VHS3	Q08438	674 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	GPG1	P53130	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	SIR3	P06701	978 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	PEX1	P24004	1043 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	IRC10	Q08118	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	MLH3	Q12083	715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	KIN3	P22209	435 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YKU70	P32807	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	BEM4	P39011	633 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	STU2	P46675	888 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YAP1802	P53309	568 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	DOS2	P54858	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	THI22	Q06490	572 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	USV1	Q12132	391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	SEC65	P29478	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	BCS1	P32839	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	NDC80	P40460	691 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YIL077C	P40508	320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	FHN1	P53279	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	ECM9	Q02202	377 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YHM2	Q04013	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	HFD1	Q04458	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YPS7	Q06325	596 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	CDC43	P18898	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	SEC15	P22224	910 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	PET127	P32606	800 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	HXT7	P39004	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	PIG2	P40187	538 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	BIT2	P38346	545 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	YEN1	P40028	759 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	BIT61	P47041	543 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	RFX1	P48743	811 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RSM27	YGR215W	POM34	Q12445	299 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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