RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	VPS60	Q03390	229 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PKH1	Q03407	766 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YPR071W	Q12346	211 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.27	□□□□□ -1.41	not detected
PSH1	YOL054W	YKL133C	P36066	463 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	GPT2	P36148	743 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YRO2	P38079	344 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.27	□□□□□ -1.41	not detected
PSH1	YOL054W	CTH1	P47976	325 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YGR130C	P53278	816 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	WAR1	Q03631	944 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	CBP3	P21560	335 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	MXR1	P40029	184 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	SMC3	P47037	1230 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YJL045W	P47052	634 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YNR014W	P53719	212 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	UBP16	Q02863	499 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	FCP1	Q03254	732 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	COG4	Q06096	861 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	ACM1	Q08981	209 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	LAM4	P38800	1345 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	RAD53	P22216	821 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	IMP2'	P32351	346 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	6.25	□□□□□ -1.41	not detected
PSH1	YOL054W	ALG2	P43636	503 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	MAL11	P53048	616 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	RTS3	P53289	263 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	NCE103	P53615	221 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	TPP1	Q03796	238 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.24	□□□□□ -1.41	not detected
PSH1	YOL054W	PIF1	P07271	859 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	STE11	P23561	717 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	PRO1	P32264	428 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	PMT3	P47190	753 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	TNA1	P53322	534 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	VPS75	P53853	264 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YNL193W	P53870	558 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YCG1	Q06680	1035 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	TAH18	Q12181	623 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	MDM12	Q92328	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	RAD26	P40352	1085 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.22	□□□□□ -1.41	not detected
PSH1	YOL054W	PHO13	P19881	312 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	MEF1	P25039	761 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	VBA3	P25594	458 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	RSC6	P25632	483 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YSC84	P32793	468 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	PXL1	P36166	706 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	PSY4	P38193	441 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	YGR237C	P50089	785 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	POM152	P39685	1337 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSH1	YOL054W	SFA1	P32771	386 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	REC104	P33323	182 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SLA2	P33338	968 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CCZ1	P38273	704 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	TOK1	P40310	691 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	EPL1	P43572	832 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	ALT1	P52893	592 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	ALF1	P53904	254 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RRI2	Q12348	645 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	GRX7	P38068	203 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	DOT5	P40553	215 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YGL082W	P53155	381 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	MAL13	P53338	473 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	THI73	Q07904	523 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	TMA16	Q08687	178 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CTI6	Q08923	506 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	APL4	Q12028	832 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	DCS2	Q12123	353 aa		6.2	□□□□□ -1.42

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