RNA–Protein interactions for RNA: YNL035C

YNL035C, Transcript of Nuclear protein of unknown function, yeast

Gene YNL035C, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL035C	YNL035C	SEC65	P29478	273 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	HIR1	P32479	840 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	OAF3	P36023	863 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	BIT2	P38346	545 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	MSS4	P38994	779 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	PEA2	P40091	420 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	VHR1	P40522	640 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	PFA3	P42836	336 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	YAP6	Q03935	383 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	HMI1	Q12039	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	HFI1	Q12060	488 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	CDC6	P09119	513 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	YKR075C	P36155	307 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	MAL31	P38156	614 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	FAT1	P38225	669 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	UBP5	P39944	805 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SPC105	P53148	917 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	ORC4	P54791	529 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	GCN5	Q03330	439 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SKY1	Q03656	742 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	PHM6	Q05637	104 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	DUS4	Q06063	367 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	RXT3	Q07458	294 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	GPR1	Q12361	961 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	TOP1	P04786	769 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	CHA4	P43634	648 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	NCS6	P53088	359 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	VPS62	P53285	467 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	ASI2	P53895	289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SWM1	Q12379	170 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	NPC2	Q12408	173 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	ATP4	P05626	244 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	YHR202W	P38887	602 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SPT20	P50875	604 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	SLD3	P53135	668 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	PKH1	Q03407	766 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL035C	YNL035C	CDC20	P26309	610 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	NIC96	P34077	839 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YBP2	P53169	641 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	APM4	Q99186	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YLR415C	O13578	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	SWI6	P09959	803 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	ATP12	P22135	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YKU70	P32807	602 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	APN2	P38207	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	BEM4	P39011	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PLB1	P39105	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	EMP65	P40085	556 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	MET14	Q02196	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	CDA2	Q06703	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PEX19	Q07418	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	GAL1	P04385	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	NGG1	P32494	702 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	VID28	P40547	921 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PIP2	P52960	996 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PEX15	Q08215	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
YNL035C	YNL035C	PIF1	P07271	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	KCC4	P25389	1037 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 127.7 ms