RNA–Protein interactions for RNA: YBR267W

REI1, Transcript of Cytoplasmic pre-60S factor, yeast

Gene REI1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REI1	YBR267W	CBP3	P21560	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	GSY1	P23337	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CCL1	P37366	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MRX3	P38172	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RIM4	P38741	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	GAA1	P39012	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SAD1	P43589	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SUM1	P46676	1062 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	YPT11	P48559	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	HST3	P53687	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	FUS2	Q05670	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NUT2	Q06213	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MET32	Q12041	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	TIP41	Q12199	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RRD2	Q12461	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MCM1	P11746	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CYC8	P14922	966 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	GSY2	P27472	705 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CSE2	P33308	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RRM3	P38766	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	ROG3	P43602	733 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	GIS4	Q04233	774 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	ECM7	Q06200	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	ESC2	Q06340	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	ESC8	Q08119	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	DCS2	Q12123	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	HAP2	P06774	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CDC4	P07834	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CDC6	P09119	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	GLN3	P18494	730 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RAD27	P26793	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	COT1	P32798	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SCD5	P34758	872 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	HMT1	P38074	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	ARP1	P38696	384 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SHE10	P53075	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	DIP5	P53388	608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SGO1	Q08490	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	WHI5	Q12416	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	FRT1	Q99332	602 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CAB3	P36076	571 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	TEL1	P38110	2787 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	YIR016W	P40572	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CCH1	P50077	2039 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RTC4	P53850	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	FAR11	P53917	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MFB1	Q04922	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	YLH47	Q06493	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
REI1	YBR267W	HIS5	P07172	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MRPL33	P20084	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	HCM1	P25364	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RPC53	P25441	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MNR2	P35724	969 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RGD1	P38339	666 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MGE1	P38523	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	FMO1	P38866	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MAF1	P41910	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	BRE2	P43132	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RTT102	P53330	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	YNL146W	P53906	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	WAR1	Q03631	944 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NSE1	Q07913	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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