RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	TRM2	P33753	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	RPC25	P35718	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MRPL7	P36519	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YHR054C	P38780	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	BUD16	P39988	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	JHD1	P40034	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ESL1	P40456	1118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ULI1	P43604	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	HFM1	P51979	1187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	TPO2	P53283	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	CDC42	P19073	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	KIP1	P28742	1111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SPC110	P32380	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	VFA1	P40080	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	OPT1	P40897	799 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SMC3	P47037	1230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	STR2	P47164	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ESBP6	P53918	673 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
FMP46	YKR049C	TBF1	Q02457	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SLX4	Q12098	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	CTF3	Q12748	733 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	HIP1	P06775	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	IME1	P21190	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MCM2	P29469	868 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RAD54	P32863	898 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SMC1	P32908	1225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CSE2	P33308	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PTC4	P38089	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	APN2	P38207	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YHR202W	P38887	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YAP5	P40574	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	HXT8	P40886	569 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CPR7	P47103	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	VPS70	P47161	811 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
FMP46	YKR049C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PPM1	Q04081	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RGA2	Q06407	1009 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SDH5	Q08230	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	HMI1	Q12039	706 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ATG9	Q12142	997 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	HAP2	P06774	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	POL3	P15436	1097 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TUP1	P16649	713 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	NIP100	P33420	868 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CSG2	P35206	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	KDX1	P36005	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RTT107	P38850	1070 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YEL023C	P39992	682 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	POL31	P46957	487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ALT1	P52893	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CTR9	P89105	1077 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	EEB1	Q02891	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CDD1	Q06549	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ESC8	Q08119	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MOT1	P32333	1867 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	GAL10	P04397	699 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CHS1	P08004	1131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CYC8	P14922	966 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	IDI1	P15496	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SPO12	P17123	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	VPS3	P23643	1011 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RRT12	P25381	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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