RNA–Protein interactions for RNA: YFR003C

YPI1, Transcript of Regulatory subunit of the type I protein phosphatase (PP1) Glc7p, yeast

Gene YPI1, Length 468 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPI1	YFR003C	HUL4	P40985	892 aa		10.14	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	MAF1	P41910	395 aa		10.14	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	ULI1	P43604	169 aa		10.14	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	YJL045W	P47052	634 aa		10.14	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	STB4	P50104	949 aa		10.14	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	MED1	Q12321	566 aa		10.14	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	VPS3	P23643	1011 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	DSF2	P38213	736 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	SPC98	P53540	846 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	WSC3	Q12215	556 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	PEX1	P24004	1043 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	PEX2	P32800	271 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.12	□□□□□ -0.79	not detected
YPI1	YFR003C	RGD1	P38339	666 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	YHR054C	P38780	354 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	BIM1	P40013	344 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	HST1	P53685	503 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	STP1	Q00947	519 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	TCO89	Q08921	799 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	CTF3	Q12748	733 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	GAL80	P04387	435 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	APE1	P14904	514 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	PGS1	P25578	521 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	PPZ1	P26570	692 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	SAF1	P38352	637 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	BFA1	P47113	574 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.11	□□□□□ -0.79	not detected
YPI1	YFR003C	DON1	Q05610	365 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	MLH2	Q07980	695 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	CHS2	P14180	963 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	OM45	P16547	393 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	TRK2	P28584	889 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	BDH2	P39713	417 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	FTR1	P40088	404 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	MGA2	P40578	1113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	YPL216W	Q08964	1102 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	RRD2	Q12461	358 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	SPE1	P08432	466 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	HMG2	P12684	1045 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	BET2	P20133	325 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	MRM1	P25270	412 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	TBS1	P38114	1094 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	TOS3	P43637	560 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	TIM8	P57744	87 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	ADA2	Q02336	434 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	SGO1	Q08490	590 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YPI1	YFR003C	KEX2	P13134	814 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	RIM4	P38741	713 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	LCB2	P40970	561 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	POL31	P46957	487 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	CDD1	Q06549	142 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	PDE1	P22434	369 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	ELM1	P32801	640 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	TAF1	P46677	1066 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	TAF10	Q12030	206 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	UBP5	P39944	805 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	DAS1	P47005	663 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	SMC3	P47037	1230 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	YPT11	P48559	417 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	TBF1	Q02457	562 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	NSE5	Q03718	556 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	SWI3	P32591	825 aa		10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	PTC4	P38089	393 aa		10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	YBR284W	P38150	797 aa		10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	YER130C	P39959	443 aa		10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	YDR344C	Q05510	147 aa		10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	IRC10	Q08118	586 aa		10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
YPI1	YFR003C	APM4	Q99186	491 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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