RNA–Protein interactions for RNA: YDR138W

HPR1, Transcript of Subunit of THO/TREX complexes, yeast

Gene HPR1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPR1	YDR138W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	HSE1	P38753	452 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ALT1	P52893	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	HLR1	Q04429	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	MSM1	P22438	575 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	NNK1	P36003	928 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SPC72	P39723	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	NIT3	P49954	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	TFC6	Q06339	672 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SAM35	P14693	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SAC7	P17121	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SEC65	P29478	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RPD3	P32561	433 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RKM3	P38222	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ESL1	P40456	1118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	HIM1	Q06674	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	THI21	Q08975	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	FOB1	O13329	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	FUN30	P31380	1131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	YKR018C	P36114	725 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	EMP65	P40085	556 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	YIR007W	P40566	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RTP1	Q12751	981 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SWI6	P09959	803 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	TAF1	P46677	1066 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	GPR1	Q12361	961 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ALG14	P38242	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SDH1	Q00711	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SRC1	Q03707	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	TPP1	Q03796	238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	CRR1	Q05790	422 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SDH5	Q08230	162 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	IMP2'	P32351	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	CEP3	P40969	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	IRC5	P43610	853 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	BNA2	P47125	453 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	TEP1	P53916	434 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	MED1	Q12321	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	HXT4	P32467	576 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	DUN1	P39009	513 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	CEM1	P39525	442 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	YIL092W	P40497	633 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	TNA1	P53322	534 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	NUR1	Q12066	484 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ADH4	P10127	382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	CHS3	P29465	1165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	STE13	P33894	931 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	BEM4	P39011	633 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	ASK10	P48361	1146 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	ASM4	Q05166	528 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	GAS5	Q08193	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	FLR1	P38124	548 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YHR202W	P38887	602 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	VPS8	P39702	1274 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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