RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	MAS2	P11914	482 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	CAJ1	P39101	391 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	ATG3	P40344	310 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	MTF2	P10849	440 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	SNA3	P14359	133 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	AFT1	P22149	690 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	SMC1	P32908	1225 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	NIP100	P33420	868 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	FLR1	P38124	548 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	CCC2	P38995	1004 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	YNL146W	P53906	100 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	MSC2	Q03455	724 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	TUP1	P16649	713 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	XRS2	P33301	854 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	NPP2	P39997	493 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	IES1	P43579	692 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	CUL3	P53202	744 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	ESBP6	P53918	673 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	ECM7	Q06200	448 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	TOM1	Q03280	3268 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	PSF2	P40359	213 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	HXT8	P40886	569 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	ACF4	P47129	309 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	YJR107W	P47145	328 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	YOL098C	Q12496	1037 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	MOT1	P32333	1867 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.77	□□□□□ -0.53	not detected
DDR2	YOL052C-A	AIM21	P40563	679 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SKP2	P42843	763 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	YDR090C	Q03193	310 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	ATG11	Q12527	1178 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	KIP1	P28742	1111 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	TMT1	P32643	299 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	EFM4	P40516	257 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.76	□□□□□ -0.53	not detected
DDR2	YOL052C-A	TAD1	P53065	400 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	ENV11	P53246	860 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.76	□□□□□ -0.53	not detected
DDR2	YOL052C-A	DAS2	Q12084	232 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SUT2	Q12286	268 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	YDL206W	Q12424	762 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	PET123	P17558	318 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SRB4	P32569	687 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	BCS1	P32839	456 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	FTR1	P40088	404 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	ORC5	P50874	479 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	VPS60	Q03390	229 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	RTP1	Q12751	981 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	PET111	P08468	800 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	HXT1	P32465	570 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	RAD54	P32863	898 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	JNM1	P36224	373 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	MRX3	P38172	270 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SEC9	P40357	651 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	MMM1	P41800	426 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	PRY3	P47033	881 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SLX4	Q12098	748 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	RIF1	P29539	1916 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	WHI2	P12611	486 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	RAD57	P25301	460 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	MSS51	P32335	436 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SWI3	P32591	825 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	MMS4	P38257	691 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	VID24	P38263	362 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	NDC80	P40460	691 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	CEP3	P40969	608 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	TRS130	Q03660	1102 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SML1	Q04964	104 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	VAC14	Q06708	880 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	DAS1	P47005	663 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	BOP3	P53958	396 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53

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