RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	RPC31	P17890	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	VBA3	P25594	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	CHS3	P29465	1165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MLF3	P32047	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YKL107W	P34251	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	RIM11	P38615	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MSC7	P38694	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	CKB2	P38930	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	ESL1	P40456	1118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MET13	P53128	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MAK10	Q02197	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	PHO81	P17442	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	PCL2	P25693	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	DUR3	P33413	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	SIT1	P39980	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	NDE1	P40215	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YTA6	P40328	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	IML2	P47031	731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	RCF1	Q03713	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	SSP2	Q08646	371 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	SRD1	P09007	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	DAL5	P15365	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	RGP1	P16664	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MSH3	P25336	1018 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MCM10	P32354	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	DID4	P36108	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	PET10	P36139	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	HIS6	P40545	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YJR096W	P47137	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YNR063W	P53749	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	HEH2	Q03281	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	VPS5	Q92331	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	TOP3	P13099	656 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SFL1	P20134	766 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RER1	P25560	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RKM3	P38222	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YIL165C	P40446	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	CAF16	P43569	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	VTC2	P43585	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ALG2	P43636	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
RPS1B	YML063W	YGL176C	P46945	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SGM1	P47166	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	UBA2	P52488	636 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
RPS1B	YML063W	PEX13	P80667	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ROD1	Q02805	837 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PHM6	Q05637	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RMP1	Q12530	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	GCN2	P15442	1659 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	CDC9	P04819	755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NUP120	P35729	1037 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	BSD2	P38356	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MBP1	P39678	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	HNT2	P49775	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SKP1	P52286	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SLD3	P53135	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	GUD1	Q07729	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SDH5	Q08230	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MRP7	P12687	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MSM1	P22438	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SPC29	P33419	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SAS3	P34218	831 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YKL077W	P36081	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	KTR4	P38131	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	BIT2	P38346	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RKM2	Q03942	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	EST2	Q06163	884 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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